F.stat.null(TANOVA)
F.stat.null()所属R语言包:TANOVA
Generation of null F-statistics by bootstrap method
代空的F-统计的引导方法
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This is an internal function to be called by tanova to generate null distribution of F-statistics.
这是一个内部函数被调用tanova生成空的F-统计量的分布。
用法----------Usage----------
F.stat.null(data,f1,f2,type,trim=0,B=100,equal.size=FALSE,eb=FALSE)
F.stat.null2(data,f1,f2,tp,type,B=100,trim=trim,eb=FALSE)
参数----------Arguments----------
参数:data
a data matrix containing expression values. Row and column represent gene (probe set) and array respectively
一个数据矩阵表达式的值。基因“(探针组)和阵列行和列代表
参数:f1
a vector containing the levels of a factor in each array
一个向量,包含在每个阵列中的一个因素的水平
参数:f2
a vector containing the levels of a factor in each array
一个向量,包含在每个阵列中的一个因素的水平
参数:tp
a vector with length equal to the number of arrays. Each entry indicates the time point for the corresponding array. tp takes values 1,2,3 .... For non-time course data, let tp=0.
一个向量,其长度等于阵列的数目。每个条目表示的时间点相应的数组。 TP值1,2,3 ....对于非时间当然数据,让总磷= 0。
参数:type
type of test the null F-statistics is for, 1 for, 2 for, 3 for, 4 for
类型的测试是空的F-统计,1,2,3,4
参数:trim
the fraction (0 to 0.5) of observations to be trimmed from each end of x before the mean is computed. Values of trim outside that range are taken as the nearest endpoint.
从每个端部的x的观测值(0~0.5)的馏分进行修整前的平均值计算。最近的端点修剪超出该范围的值。
参数:B
number of bootstrap resampling
引导重采样数
参数:equal.size
a logical indicator of whether the number of replicates under each biological condition is equal. Default is FALSE.
一个逻辑指标是否每个生物条件下的重复数是相等的。默认值是false。
参数:eb
whether to use Bayesian prior
是否使用贝叶斯前
值----------Value----------
<table summary="R valueblock"> <tr valign="top"><td>F.null</td> <td> null F-statistics, each column is a bootstrap sampling.</td></tr> </table>
<table summary="R valueblock"> <tr valign="top"> <TD> F.null</ TD> <TD>空F-统计,每一列是一个bootstrap抽样。</ TD> </ TR> </ TABLE>
(作者)----------Author(s)----------
Baiyu Zhou <a href="mailto:zhouby98@stanford.edu">zhouby98@stanford.edu</a> & Weihong xu <a href="mailto:weihongx@stanford.edu">weihongx@stanford.edu</a>
参见----------See Also----------
tanova
tanova
实例----------Examples----------
##data=matrix(rnorm(10000,mean=6, sd=1),nrow=500, ncol=20)[#数据矩阵(rnorm(10000,平均= 6,SD = 1),NROW = 500,NCOL = 20)]
##f1=rep(c(1,2), each=10)[#F1 = REP(C(1,2),分别为= 10)]
##f2=rep(c(1,2), 10)[#F2 = REP(C(1,2),10)]
##F.stat.null(data,f1,f2,type=1,trim=0,B=100,equal.size=FALSE,eb=FALSE)[#F.stat.null(数据,F1,F2,键入= 1,装备= 0,B = 100,equal.size = FALSE,EB = FALSE)]
转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。
注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
|