spearman.dist(bioDist)
spearman.dist()所属R语言包:bioDist
Spearman correlational distance
斯皮尔曼相关性的距离
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Calculate pairwise Spearman correlational distances, i.e. 1-SPEAR or 1-|SPEAR|, for all rows of a matrix and return a dist object.
计算成对斯皮尔曼相关性的距离,即1矛或1 - 矛,一个矩阵的所有行,并返回一个dist对象。
用法----------Usage----------
spearman.dist(x, ...)
参数----------Arguments----------
参数:x
n by p matrix or ExpressionSet; if x is an ExpressionSet, then the function uses its 'exprs' slot.
n的p矩阵ExpressionSet;如果x是一个ExpressionSet,那么该函数使用其exprs“槽。
参数:...
arguments passed to spearman.dist:
参数传递spearman.dist:
absif TRUE, then 1-|SPEAR| else 1-SPEAR; default is TRUE.
absifTRUE,然后1 - |长矛|其他1矛;默认为TRUE。
diagif TRUE, then the diagonal of the distance matrix will be displayed; default is FALSE.
diagifTRUE,然后在距离矩阵对角线将显示,默认为false。
upperif TRUE, then the upper triangle of the distance matrix will be displayed; default is FALSE.
upperifTRUE,然后在距离矩阵的上三角将显示,默认为false。
samplefor the ExpressionSet method: if TRUE (the default), then distances are computed between samples.
samplefor的ExpressionSet方法:如果为TRUE(默认),然后距离计算样本之间。
Details
详情----------Details----------
We call cor with the appropriate arguments to compute the row-wise correlations.
我们称之为cor用适当的参数来计算行明智的相关性。
值----------Value----------
One minus the Spearman correlation, between rows of x, are returned, as an instance of the dist class.
一减之间行x,Spearman相关,返回,dist类的一个实例。
作者(S)----------Author(s)----------
Beiying Ding
参见----------See Also----------
cor.dist, tau.dist, euc, man, KLdist.matrix, KLD.matrix,
cor.dist,tau.dist,euc,man,KLdist.matrix,KLD.matrix
举例----------Examples----------
x <- matrix(rnorm(200), nrow = 5)
spearman.dist(x)
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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