KLdist.matriX(bioDist)
KLdist.matriX()所属R语言包：bioDist
Discrete version of Kullback-Leibler Distance (KLD)
离散版本的Kullback-Leibler距离（KLD的）
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Calculate the KLD by binning continuous data.
通过分级的连续数据计算KLD的。
KL distance is calculated using the formula
KL距离计算公式
用法----------Usage----------
KLdist.matrix(x, ...)
参数----------Arguments----------
参数：x
n by p matrix or a list or an object of a class that extends eSet. If x is an object of a class derived from eSet (ExpressionSet,SnpSet etc), then the values returned by the exprs function are used.
n的p矩阵或一个列表或一个类，扩展ESET的对象。如果x是从ESET（ExpressionSet，SnpSet等）派生的类的一个对象，然后exprs函数返回值使用。
参数：...
arguments passed to KLdist.matrix:
参数传递KLdist.matrix：
gridsizethe number of grid points used to select the optimal bin width of the histogram used to estimate density. If no value is supplied, the grid size is calculated internally; default is NULL.
gridsize用来估计密度直方图用于选择最佳槽宽度的网格点的数量。如果没有提供值，内部计算的网格大小，默认是NULL。
symmetrizeif TRUE, then symmetrize; the default is FALSE.
symmetrize如果TRUE，然后symmetrize;默认的是FALSE。
diagif TRUE, then the diagonal of the distance matrix will be displayed; the default is FALSE.
diag如果TRUE，然后在距离矩阵对角线将显示默认的是FALSE。
upperif TRUE, then the upper triangle of the distance matrix will be displayed; default is FALSE.
upper如果TRUE，然后在距离矩阵的上三角将显示默认的是FALSE。
samplefor eSet methods: if TRUE, then the distances are computed between samples, otherwise, between features; the default is TRUE.
sample为ESET方法：如果TRUE，然后距离计算样本之间，否则，功能之间;默认的是TRUE。
Details
详情----------Details----------
The data are binned, and then the KL distance between the two discrete distributions is computed and used. The distance is computed between rows of the input matrix (except if the input is an object of a class that extends eSet and sample is TRUE.
分级数据，然后计算两者之间的离散分布的KL距离和使用。输入矩阵的行之间的距离计算（除非输入的是一个对象的一个类，扩展Eset和sample是TRUE。
The presumption is that all samples have the same number of observations. The list method is meant for use when samples sizes are unequal.
推定的是，所有样品有相同数量的意见。列表的方法是使用时，样本大小是不平等的。
值----------Value----------
An object of class dist is returned.
dist类的对象被返回。
作者（S）----------Author(s)----------
Beiying Ding
参见----------See Also----------
cor.dist, spearman.dist, tau.dist,euc,
cor.dist，spearman.dist，tau.dist，euc
举例----------Examples----------
x <- matrix(rnorm(100), nrow = 5)
KLdist.matrix(x, symmetrize = TRUE)
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注：
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注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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发表于 2012-2-25 13:32:36
