closest.top(bioDist)
closest.top()所属R语言包:bioDist
Find the closest genes.
查找最接近的基因。
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Find the closest genes to the supplied target gene based on the supplied distances.
提供的目标基因的基础上提供距离最近的基因。
用法----------Usage----------
closest.top(x, dist.mat, top)
参数----------Arguments----------
参数:x
the name of the gene (feature) to use.
基因(功能)使用的名称。
参数:dist.mat
either a dist object or a matrix of distances.
无论是区对象或距离矩阵。
参数:top
the number of closest genes desired.
最接近所需的基因数目。
Details
详情----------Details----------
The feature named x must be in the supplied distances. If so, then the top closest other features are returned.
名为x的功能,必须在所提供的距离。如果是这样,然后返回最接近top其他功能。
值----------Value----------
A vector of names of the top closest features.
top最接近的功能名称的向量。
作者(S)----------Author(s)----------
Beiying Ding
参见----------See Also----------
cor.dist, spearman.dist, tau.dist,euc,
cor.dist,spearman.dist,tau.dist,euc
举例----------Examples----------
data(sample.ExpressionSet)
sE <- sample.ExpressionSet[1:100,]
d1 <- KLdist.matrix(sE, sample = FALSE)
closest.top(featureNames(sE)[1], d1, 5)
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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