R语言 BGmix包 plotTrace()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

plotTrace(BGmix)
plotTrace()所属R语言包：BGmix

                                         Trace plots for BGmix output.
                                         跟踪输出图BGmix。

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Trace plots are plotted for all scalar parameters. Optionally, traces are plotted for parameters indexed by genes, but for selected genes only.
所有标量参数的跟踪图绘制。可选的痕迹，绘制基因索引的参数，但只对选定的基因。


用法----------Usage----------


plotTrace(res, q.beta = T, q.sig = T, q.z = T, ind.genes = (1:3))



参数----------Arguments----------

参数：res
list object output from 'ccTrace'  
列出对象的输出从ccTrace“


参数：q.beta
logical. Plot trace of beta (gene effect) parameters?
逻辑。图微量的β（基因效应）参数？


参数：q.sig
logical. Plot trace of gene variances?
逻辑。图跟踪基因差异？


参数：q.z
logical. Plot trace of gene allocation parameters?
逻辑。图跟踪基因分配参数？


参数：ind.genes
indices of genes for which to plot gene parameters.
基因绘制基因参数指标。


作者（S）----------Author(s)----------


Alex Lewin



举例----------Examples----------


## Note this is a very short MCMC run![＃注意：这是一个很短的MCMC运行！]
## For good analysis need proper burn-in period.[＃为了获得良好的分析，需要适当的老化期。]
data(ybar,ss)
outdir <- BGmix(ybar, ss, c(8,8), nburn=0, niter=100, nthin=1)
tr <- ccTrace(outdir)
plotTrace(tr)
plotTrace(tr,q.beta=TRUE,q.sig=FALSE,q.z=FALSE,ind.genes=1)
plotTrace(tr,q.beta=FALSE,q.sig=FALSE,q.z=TRUE,ind.genes=sample(1:1000,5))

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