Calculate_Row_Weights(bgafun)
Calculate_Row_Weights()所属R语言包:bgafun
Calculate the sequence weights for all the rows in my amino,using label as the grouping
所有排在我的氨基酸序列重量计算,使用标签分组
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This will calculate the sequence weights for each group using the Heinkoff and Heinkoff method. Each residue in the sequence is assigned a weight depending on how unique it is in the column. The sequence weight is then the sum of these weights, and the total weight is the number of groups
这将计算每个使用Heinkoff和Heinkoff方法组序列加权。每个序列中的残留物分配一个权重,根据独特的,因为它是在列。序列的重量,然后这些权重的总和,总重量组数
用法----------Usage----------
Calculate_Row_Weights(my_amino,label)
参数----------Arguments----------
参数:my_amino
Matrix representation of alignment generated by convert\_aln\_amino
矩阵表示对齐转换\ _aln \ _amino
参数:label
Vector or factor that shows the group representation for each sequence in the alignment
向量或因素,显示在每个序列组表示对齐
参考文献----------References----------
举例----------Examples----------
library("bgafun")
data(LDH.amino.gapless)
data(LDH.groups)
LDH.weights=Calculate_Row_Weights(LDH.amino.gapless,LDH.groups)
sum(LDH.weights)
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
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