readCompressedData(BeadDataPackR)
readCompressedData()所属R语言包:BeadDataPackR
Extract data for specific bead-types from a compressed file
从压缩文件中提取特定珠类型的数据
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Given a list of probeIDs this function can scan a compressed .bab file for matching entries and return the data as a data.frame within R, rather than decompressing the data and generating new files.
这个函数给予了probeIDs名单可以扫描压缩。BAB文件匹配的条目,并返回作为在R的数据框的数据,而不是解压缩数据并生成新文件。
用法----------Usage----------
readCompressedData(inputFile, path = ".", probeIDs = NULL)
参数----------Arguments----------
参数:inputFile
The name of the .bab file to be read in.
要读入的。BAB文件的名称
参数:path
Path to where the input file can be found. Default is the current working directory.
输入文件中可以找到的路径。默认为当前工作目录。
参数:probeIDs
List the probe IDs for which data should be obtained. If left NULL then every probe on the array is returned.
列出的探测数据,而应获得的ID。如果为NULL,然后返回探针阵列上的每个。
值----------Value----------
If the requested probe IDs are present the function returns a data.frame with one row per bead. If the probes are not found in the file then the function returns NULL and informs the user.
如果所要求的探针ID是目前该函数返回每一个珠行数据框。如果探针没有在文件中找到,则函数返回NULL,并通知用户。
作者(S)----------Author(s)----------
Mike L. Smith
举例----------Examples----------
dataPath <- system.file("extdata", package = "BeadDataPackR")
readCompressedData(inputFile = "example.bab", path = dataPath, probeIDs = c(10008, 10010))
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注:
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注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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