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R语言 BeadDataPackR包 decompressBeadData()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-25 13:07:18 | 显示全部楼层 |阅读模式
decompressBeadData(BeadDataPackR)
decompressBeadData()所属R语言包:BeadDataPackR

                                         Decompress a file in the beadarray binary format
                                         在beadarray二进制格式的解压缩文件

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Decompressed a file create by BeadDataPackR.  The original files that were compressed will be restored as accurately as possible, depending upon the degree of precision specified during the compression.
解压缩文件创建BeadDataPackR。恢复被压缩的原始文件将尽可能准确,取决于压缩过程中指定的精度程度。


用法----------Usage----------


decompressBeadData(input, inputPath = ".", outputMask = NULL, outputPath = ".",
                   outputNonDecoded = FALSE, roundValues = TRUE, progressBar = TRUE)



参数----------Arguments----------

参数:input
The name of the .bab file(s) to be read.  Can be a vector of file names, such as generated by list.files().  
的。BAB文件的名称(S)被读取。可以是一个文件名,如生成list.files(),向量。


参数:inputPath
Path where the compress file is located.  The default is to use the current working directory.  
位于压缩文件的路径。默认是使用当前工作目录。


参数:outputMask
Text specify the names of the output files.  The output files will have ".txt", "_Grn.locs" and (if approriate "_Red.locs") appended to this mask.  If left NULL the original names of the section will be used.  
文字指定输出文件的名称。输出文件将有“TXT”,“_Grn.locs”和(如果approriate“_Red.locs”)附加到这个面具。如果保留为空,部分原来的名称将被使用。


参数:outputPath
Path to where the uncompressed version of the files should be written to.  The default is to use the current working directory.  
解压缩文件的版本应写入的路径。默认是使用当前工作目录。


参数:outputNonDecoded
If TRUE the undecoded beads will be included in the output .txt file.  They will have ProbeID 0 and intensity 0, but the bead centre coordinates will be included.  
如果是TRUE,未解码的珠子,将包括输出。txt文件。他们将ProbeID 0 0和强度,但将包括珠的中心坐标。


参数:roundValues
The original Illumina text files give the bead centre coordinates to 7 significant figures.  When this argument is TRUE decompressed files are also truncated in this manner, whilst FALSE writes them to the full precision they are stored in the compressed file.  
原Illumina的文本文件给珠中心协调7个有效数字。当这种说法是真实的解压缩文件也以这种方式被截断,而假的,并将其写入到它们存储在压缩文件中全精度。


参数:progressBar
By default the function uses a txtProgressBar to indicate progress through the compression.  Setting this argument to FALSE supresses the drawing of this progress bar.  
默认情况下,该函数使用一个txtProgressBar表明通过压缩进度。这个参数设置为FALSE supresses这个进度栏的图纸。


值----------Value----------

Called primarily for its side effect, in which two (or three) files are written to the disk.  These files should be representative of the original files that were compressed.  The function returns, invisibly, the number of lines written in the .txt file.
称为主要用于其副作用,在这两个(或三个)的文件被写入到磁盘。这些文件应该被压缩的原始文件的代表。函数返回时,不可见的。txt文件中写入的行数。


作者(S)----------Author(s)----------



Mike L. Smith




举例----------Examples----------


    dataPath <- system.file("extdata", package = "BeadDataPackR")
    decompressBeadData(input = "example.bab", inputPath = dataPath, outputPath = ".")

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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