spider-package(spider)
spider-package()所属R语言包:spider
Species Identity and Evolution in R
在R物种的身份和演化
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Spider: SPecies IDentity and Evolution in R, is an R package implementing a number of useful analyses for DNA barcoding studies and associated research into species delimitation and speciation. Included are functions for generating summary statistics from DNA barcode data, assessing specimen identification efficacy, and for testing and optimising divergence threshold limits. In terms of investigating evolutionary and taxonomic questions, techniques for sliding window, population aggregate, and nucleotide diagnostic analyses are also provided.
蜘蛛物种鉴别和演化R,是一个R包,执行一些有用的分析DNA条形码研究和相关研究物种划分和形态。包括产生DNA条形码数据的汇总统计数据,标本鉴定评估疗效,测试和优化分歧阈值限制的功能。在调查的进化和分类问题,滑动窗口技术,人口聚集,并核苷酸的诊断分析。
The complete list of functions can be displayed with library(help=spider).
功能的完整列表可以显示library(help=spider)。
More information, including a tutorial on the use of spider can be found at http://spider.r-forge.r-project.org.
更多信息,包括蜘蛛的使用教程可以在http://spider.r-forge.r-project.org。
Details
详细信息----------Details----------
A few of the key functions provided by spider:
天基信息平台提供的几个关键功能:
DNA barcoding: bestCloseMatch, nearNeighbour, threshID, threshOpt.
DNA条形码技术:bestCloseMatch,nearNeighbour,threshID,threshOpt。
Sliding window: slidingWindow, slideAnalyses, slideBoxplots.
滑动窗口:slidingWindow,slideAnalyses,slideBoxplots。
Nucleotide diagnostics: nucDiag.
核酸诊断:nucDiag。
Morphological techniques: paa.
形态技术:paa。
(作者)----------Author(s)----------
Samuel Brown, Rupert Collins, Stephane Boyer, Marie-Caroline Lefort, Jagoba Malumbres-Olarte, Cor Vink, Rob Cruickshank
Maintainer:
Samuel Brown <s_d_j_brown@hotmail.com>
参考文献----------References----------
参见----------See Also----------
ape-package, pegas-package.
ape-package,pegas-package。
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
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