R语言 spider包 plot.haploAccum()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

plot.haploAccum(spider)
plot.haploAccum()所属R语言包：spider

                                        Plotting haplotype accumulation curves
                                         绘制单倍型累积曲线

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Plots the accumulation curves calculated by haploAccum.
绘制累积曲线计算的haploAccum。


用法----------Usage----------


## S3 method for class 'haploAccum'
plot(x, add = FALSE, ci = 2, ci.type = c("bar","line","polygon"),
    col = par("fg"), ci.col = col, ci.lty = 1, xlab, ylab = "Haplotypes", ylim,  
    main = paste(x$method, "method of haplotype accumulation", sep=" "), ...)



参数----------Arguments----------

参数：x
A "haploAccum" object obtained from haploAccum.
获得haploAccumAhaploAccum“的对象。


参数：add
Add graph to an existing graph.
将图形添加到现有的图形。


参数：ci
Multiplier for the calculation of confidence intervals from standard deviation. ci = 0 prevents the drawing of confidence intervals.
乘法器，用于从标准偏差计算的置信区间。 ci = 0防止绘图的置信区间。


参数：ci.type
Type of confidence intervals: "bar" for vertical bars, "line" for lines, and "polygon" for a shaded area.
类型的置信区间："bar"竖向杆件的，"line"线，和"polygon"的阴影区域。


参数：col
Colour for curve line.
曲线线的颜色。


参数：ci.col
Colour for lines or shaded area when "polygon".
线或阴影区域的颜色"polygon"。


参数：ci.lty
Line type for confidence interval lines or border of the "polygon".
置信区间线或边界的"polygon"的线路类型。


参数：xlab
Label for the X-axis.
出版商为X-轴。


参数：ylab
Label for the Y-axis.
出版商为Y轴。


参数：ylim
Y-axis limits.
Y-轴的限制。


参数：main
Title of the plot.
标题的图。


参数：...
Other parameters to pass to plot.
其他参数传递给图。


值----------Value----------

Plots a haplotype accumulation curve and confidence intervals depending on the options given to haploAccum.
绘制一个单倍型累积曲线，根据所给出的选项到haploAccum的置信区间。


（作者）----------Author(s)----------



Jagoba Malumbres-Olarte <j.malumbres.olarte@gmail.com>.




参考文献----------References----------



实例----------Examples----------


data(dolomedes)
#Generate multiple haplotypes[生成多个单倍型]
doloHaplo <- dolomedes[sample(37, size = 200, replace = TRUE), ]
dolocurv <- haploAccum(doloHaplo, method = "random", permutations = 100)

plot(dolocurv)
plot(dolocurv, add = FALSE, ci = 2, ci.type = "polygon", col = "blue", ci.col = "red",
    ci.lty = 1)

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。