imageProcessing(beadarray)
imageProcessing()所属R语言包:beadarray
Image processing functions
图像处理功能
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Functions for obtaining bead intensity values from raw tiff images. The three commands with the illumina prefix attempt to emulate the image processing implemented by Illumina. The medianBackground function implements a more robust background calculation recommended by Smith et al.
获得珠强度值从原始的TIFF图像的功能。与Illumina的前缀尝试的三个命令来模拟图像处理Illumina的实施。 medianBackground功能,实现更强大的后台计算,史密斯等人的建议。
用法----------Usage----------
illuminaForeground(pixelMatrix, beadCoords)
illuminaBackground(pixelMatrix, beadCoords)
illuminaSharpen(pixelMatrix)
medianBackground(pixelMatrix, beadCoords)
参数----------Arguments----------
参数:pixelMatrix
A matrix storing the individual pixel values of an image. Intended to be created by readTIFF, although any matrix can be passed as input.
矩阵存储图像的单个像素值。拟创建readTIFF,虽然任何矩阵可以作为输入传递。
参数:beadCoords
Two column matrix with each row containing a pair of coordinates representing a bead centre.
两个列的矩阵每行包含一双代表珠中心的坐标。
值----------Value----------
illuminaForeground, illuminaBackground and medianBackground return a vector of intensity values, with one entry for every row in the beadCoords argument. Any pairs of coordinates that fall outside the dimensions of the image return NA.
illuminaForeground,illuminaBackground和medianBackground强度值返回一个向量,与在beadCoords参数的每一行一个条目。任何成对的形象回报的NA的尺寸范围以外的坐标。
illuminaSharpen returns a matrix with the same dimensions as the pixelMatrix argument.
与尺寸相同作为pixelMatrix参数illuminaSharpen返回一个矩阵。
作者(S)----------Author(s)----------
Mike Smith
参考文献----------References----------
转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。
注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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