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R语言 beadarray包 imageProcessing()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-25 12:42:26 | 显示全部楼层 |阅读模式
imageProcessing(beadarray)
imageProcessing()所属R语言包:beadarray

                                        Image processing functions
                                         图像处理功能

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Functions for obtaining bead intensity values from raw tiff images.  The three commands with the illumina prefix attempt to emulate the image processing implemented by Illumina.  The medianBackground function implements a more robust background calculation recommended by Smith et al.
获得珠强度值从原始的TIFF图像的功能。与Illumina的前缀尝试的三个命令来模拟图像处理Illumina的实施。 medianBackground功能,实现更强大的后台计算,史密斯等人的建议。


用法----------Usage----------


illuminaForeground(pixelMatrix, beadCoords)
illuminaBackground(pixelMatrix, beadCoords)
illuminaSharpen(pixelMatrix)

medianBackground(pixelMatrix, beadCoords)



参数----------Arguments----------

参数:pixelMatrix
A matrix storing the individual pixel values of an image.  Intended to be created by readTIFF, although any matrix can be passed as input.
矩阵存储图像的单个像素值。拟创建readTIFF,虽然任何矩阵可以作为输入传递。


参数:beadCoords
Two column matrix with each row containing a pair of coordinates representing a bead centre.
两个列的矩阵每行包含一双代表珠中心的坐标。


值----------Value----------

illuminaForeground, illuminaBackground and medianBackground return a vector of intensity values, with one entry for every row in the beadCoords argument.  Any pairs of coordinates that fall outside the dimensions of the image return NA.
illuminaForeground,illuminaBackground和medianBackground强度值返回一个向量,与在beadCoords参数的每一行一个条目。任何成对的形象回报的NA的尺寸范围以外的坐标。

illuminaSharpen returns a matrix with the same dimensions as the pixelMatrix argument.
与尺寸相同作为pixelMatrix参数illuminaSharpen返回一个矩阵。


作者(S)----------Author(s)----------


Mike Smith



参考文献----------References----------


转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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