R语言 beadarray包 illuminaOutlierMethod()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

illuminaOutlierMethod(beadarray)
illuminaOutlierMethod()所属R语言包：beadarray

                                         Identifier outliers on an array section
                                         数组段标识符离群

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Implementation of the illumina method for excluding outliers using a fixed number of MADs (median absolute deviations) cutoff for each bead type
每个珠类型使用固定数目的MADS（平均绝对偏差）截止值剔除Illumina的方法实施


用法----------Usage----------


illuminaOutlierMethod(inten, probeList, wts=1, n = 3)



参数----------Arguments----------

参数：inten
a list of intensities  
一个强名单


参数：probeList
the IDs corresponding to each intensity value  
每个亮度值对应的ID


参数：wts
Weights associated with beads, indicating those recommended for removal by, for example, BASH  
珠与相关权重，表明这些建议去除，例如，“BASH


参数：n
number of MADs cutoff used  
MADS截止号码使用


Details

详情----------Details----------

This function is called within the summarisation routine of beadarray to exclude outliers from an array-section prior to summary. The intensities are not assumed to be on any particular scale and can result from any user-defined transformation function.
此功能被称为内beadarray summarisation例行排除离群从一个数组节简要之前。强度不认为是对任何特定的比例，可导致任何用户定义的转换功能。

Beads with weight zero do not contribute to the outlier calling.
重量零珠不出力的离群通话。


值----------Value----------

the positions in the original vector that were determined to be outliers
在原来的向量被确定为是离群的位置


作者（S）----------Author(s)----------



Mark Dunning




参见----------See Also----------

squeezedVarOutlierMethod
squeezedVarOutlierMethod


举例----------Examples----------



if(require(beadarrayExampleData)){

data(exampleBLData)

oList = illuminaOutlierMethod(logGreenChannelTransform(exampleBLData, 1), getBeadData(exampleBLData, array=1, what="ProbeID"))

}


转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。