ChaoLee1992(SPECIES)
ChaoLee1992()所属R语言包：SPECIES
Coverage-based estimators for species richness
覆盖为基础的估计物种丰富度
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This function calculates ACE and ACE-1 estimators by Chao and Lee 1992 (ACE-1 provides further bias correction based on ACE).
此函数计算ACE和ACE-1估计超和李1992年（ACE-1提供了进一步的偏置校正的基础上ACE）。
用法----------Usage----------
ChaoLee1992(n, t = 10, method = "all",conf = 0.95)
参数----------Arguments----------
参数：n
a matrix or a numerical data frame of two columns. It is also called the “frequency of frequencies” data in literature. The first column is the frequency j=1, 2…; and the second column is n_j, the number of species observed with j individuals in the sample.
两列的矩阵或数值数据框。它也被称为“频率”在文献中的数据的频率。第一列是频率j=1, 2…;，第二列是n_j，j样品中的个人观察到的物种的数量。
参数：t
a positive integer. t is the cutoff value to define the relatively less abundant species to be used in estimation. The frequencies n_j of j>t will not be used in estimating the sample coverage. The default value is t=10.
一个正整数。 t是截止值，以定义要用于估计的相对较少的丰富的物种。的频率n_jj>t不会被用于估计的样本覆盖。默认值是t = 10。
参数：method
a string. It can be any one of “ACE”, “ACE-1”, or “all”. The default is “all”.
一个字符串。它可以是任意一项“ACE”，“ACE-1”，或“全部”。默认值为“全部”。
参数：conf
a positive number ≤ 1. conf specifies the confidence level for confidence interval. The default is 0.95.
一个正数≤ 1。 conf指定的置信水平下的置信区间。默认值是0.95。
值----------Value----------
The function ChaoLee1992 returns a list of: Nhat, SE and CI.
的功能ChaoLee1992返回一个列表：Nhat，SE和CI。
<table summary="R valueblock"> <tr valign="top"><td>Nhat</td> <td> point estimate of the specified method. If the default method=“all” is used, the function returns an estimate vector including ACE, ACE-1.</td></tr> <tr valign="top"><td>SE</td> <td> standard error(s) of the point estimate(s).</td></tr> <tr valign="top"><td>CI</td> <td> confidence interval using a log transformation explained in Chao 1987.</td></tr> </table>
<table summary="R valueblock"> <tr valign="top"> <TD>Nhat</ TD> <TD>点估计的指定的方法。如果默认method=“所有”的使用，该函数返回一个估计向量，包括ACE, ACE-1。</ TD> </ TR> <tr valign="top"> <TD> X> </ TD> <TD>标准误差（S）的点估计值（S）。</ TD> </ TR> <tr valign="top"> <TD>SE</ TD > 1987年在超<TD>使用数转换的置信区间解释。</ TD> </ TR> </表>
（作者）----------Author(s)----------
Ji-Ping Wang, Department of Statistics, Northwestern University
参考文献----------References----------
Chao, A. (1987). Estimating the population size for capture-recapture data with unequal catchability. Biometrics 43, 783-791.
Chao, A., and Lee, S.-M. (1992), Estimating the Number of Classes via Sample Coverage, Journal of the American Statistical Association, 87, 210-217.
实例----------Examples----------
library(SPECIES)
##load data from the package, [＃加载数据从包中]
## "butterfly" is the famous butterfly data by Fisher 1943.[“蝴蝶”是1943年由Fisher著名的蝴蝶数据。]
data(butterfly)
##output estimates from all 4 methods using cutoff t=10[＃输出估计所有4个方法，使用截止时间T = 10]
ChaoLee1992(butterfly,t=10,method="all")
##output estimates from ACE method using cutoff t=10[产量估计从ACE方法，使用截止时间T = 10]
ChaoLee1992(butterfly,t=10,method="ACE")
转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。
注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。
|
发表于 2012-9-30 14:48:11
