p.adjustSP(spdep)
p.adjustSP()所属R语言包:spdep
Adjust local association measures' p-values
调整地方协会措施的p-值
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Make an adjustment to local association measures' p-values based on the number of neighbours (+1) of each region, rather than the total number of regions.
进行调整局部关联措施的p-值的基础上的邻居的数目(1)的每个区域中,而不是区域的总数。
用法----------Usage----------
p.adjustSP(p, nb, method = "none")
参数----------Arguments----------
参数:p
vector of p-values
p-值向量
参数:nb
a list of neighbours of class nb
一个类nb的邻居列表
参数:method
correction method as defined in p.adjust: "The adjustment methods include the Bonferroni correction ('"bonferroni"') in which the p-values are multiplied by the number of comparisons. Four less conservative corrections are also included by Holm (1979) ('"holm"'), Hochberg (1988) ('"hochberg"'), Hommel (1988) ('"hommel"') and Benjamini & Hochberg (1995) ('"fdr"'), respectively. A pass-through option ('"none"') is also included."
在p.adjust:“的调整方法包括Bonferroni校正(”邦弗朗尼“),其中p-值的比较次数乘以所定义的校正方法。还包括四个以下保守的更正霍尔姆(1979)(“霍尔姆”),霍赫贝格(1988)(“霍赫贝格”的),霍梅尔(1988)(“HOMMEL”)和Benjamini&霍赫贝格(1995)(“FDR”)中,分别通过一个传递选项(“无”)也包括在内。“
值----------Value----------
A vector of corrected p-values using only the number of neighbours + 1.
一种向量,校正仅使用的数量的邻居+ 1的p-值。
(作者)----------Author(s)----------
Danlin Yu and Roger Bivand <a href="mailto:Roger.Bivand@nhh.no">Roger.Bivand@nhh.no</a>
参见----------See Also----------
p.adjust, localG, localmoran
p.adjust,localG,localmoran
实例----------Examples----------
data(afcon)
oid <- order(afcon$id)
resG <- as.vector(localG(afcon$totcon, nb2listw(include.self(paper.nb))))
non <- format.pval(pnorm(2*(abs(resG)), lower.tail=FALSE), 2)
bon <- format.pval(p.adjustSP(pnorm(2*(abs(resG)), lower.tail=FALSE),
paper.nb, "bonferroni"), 2)
tot <- format.pval(p.adjust(pnorm(2*(abs(resG)), lower.tail=FALSE),
"bonferroni", n=length(resG)), 2)
data.frame(resG, non, bon, tot, row.names=afcon$name)[oid,]
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