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R语言 spatstat包 psst()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-9-30 14:02:18 | 显示全部楼层 |阅读模式
psst(spatstat)
psst()所属R语言包:spatstat

                                         Pseudoscore Diagnostic For Fitted Model against General Alternative
                                         Pseudoscore一般替代的拟合模型的诊断

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Given a point process model fitted to a point pattern dataset, and any choice of functional summary statistic, this function computes the pseudoscore test statistic of goodness-of-fit for the model.
由于安装阵列点数据集,点过程模型和任何选择功能汇总统计,此功能计算的pseudoscore的检验统计量的善良的适合的模型。


用法----------Usage----------


psst(object, fun, r = NULL, breaks = NULL, ...,
     trend = ~1, interaction = Poisson(), rbord = reach(interaction),
     truecoef=NULL, hi.res=NULL, funargs = list(correction="best"))



参数----------Arguments----------

参数:object
Object to be analysed. Either a fitted point process model (object of class "ppm") or a point pattern (object of class "ppp") or quadrature scheme (object of class "quad").  
对象,以进行分析。一个安装点过程模型(对象类"ppm")或阵列点(类"ppp")或正交计划(对象的类的对象"quad")。


参数:fun
Summary function to be applied to each point pattern.  
汇总函数被应用到每个点图案。


参数:r
Optional.  Vector of values of the argument r at which the function S(r) should be computed. This argument is usually not specified. There is a sensible default.  
可选。向量参数的值r的功能S(r)应计算。这种说法是没有规定。有一个合理的默认。


参数:breaks
Optional alternative to r for advanced use.  
可选替代r先进的。


参数:...
Ignored.  
忽略。


参数:trend,interaction,rbord
Optional. Arguments passed to ppm to fit a point process model to the data, if object is a point pattern. See ppm for details.  
可选。参数传递给ppm,以适应一个点过程模型的数据,如果object是一个点模式。见ppm的详细信息。


参数:truecoef
Optional. Numeric vector. If present, this will be treated as  if it were the true coefficient vector of the point process model, in calculating the diagnostic. Incompatible with hi.res.  
可选。数字矢量。如果有的话,这将被视为是真正的系数向量的点过程模型,计算诊断。不相容的hi.res。


参数:hi.res
Optional. List of parameters passed to quadscheme. If this argument is present, the model will be re-fitted at high resolution as specified by these parameters. The coefficients of the resulting fitted model will be taken as the true coefficients. Then the diagnostic will be computed for the default quadrature scheme, but using the high resolution coefficients.  
可选。参数传递给quadscheme。如果这种说法是存在的,该模型将被重新安装在高分辨率所指定这些参数。所得拟合模型的系数将被视为真正的系数。然后诊断将默认的正交计划计算,但使用高分辨率的系数。


参数:funargs
Optional. List of additional arguments to be passed to fun.  
可选。要传递给fun额外的参数列表。


Details

详细信息----------Details----------

Let x be a point pattern dataset consisting of points x[1],...,x[n] in a window W. Consider a point process model fitted to x, with conditional intensity lambda(u,x) at location u. For the purpose of testing goodness-of-fit, we regard the fitted model as the null hypothesis. Given a functional summary statistic S, consider a family of alternative models obtained by exponential tilting of the null model by S.  The pseudoscore for the null model is
让我们x是一个点模式数据点x[1],...,x[n]在一个窗口中W。考虑一个点过程模型,有条件的强度x到lambda(u,x),在安装位置u。对于善良的适合的测试的目的,我们认为合适的模型作为零假设。由于功能的摘要统计S,考虑一个家庭的替代车型指数倾斜,空模型S。空模型的pseudoscore是

where the Delta operator is
Delta运营商

the difference between the values of S for the point pattern with and without the point u.
的值之间的差的S的点图案与未经点u。

According to the Georgii-Nguyen-Zessin formula, V(r) should have mean zero if the model is correct (ignoring the fact that the parameters of the model have been estimated). Hence V(r) can be used as a diagnostic for goodness-of-fit.
根据的Georgii阮Zessin的公式,V(r)应该是均值为零,如果该模型是正确的(忽略一个事实,即模型参数的估计)。因此V(r)可以被用来作为一个诊断善良的配合。

This algorithm computes V(r) by direct evaluation of the sum and integral. It is computationally intensive, but it is available for any summary statistic S(r).
该算法计算V(r)直接评价和积分的总和。它是计算密集型的,但它可用于任何汇总统计S(r)。

The diagnostic V(r) is also called  the pseudoresidual of S. On the right hand side of the equation for V(r) given above, the sum over points of x is called the pseudosum and the integral is called the pseudocompensator.
诊断V(r),也称为pseudoresidualS。的方程,在右手侧的V(r)上面给出的总和至点x被称为的pseudosum和积分被称为pseudocompensator。


值----------Value----------

A function value table (object of class "fv"), essentially a data frame of function values.
类的对象的函数值表("fv"),本质上是一个数据框的函数值。

Columns in this data frame include dat for the pseudosum, com for the compensator and res for the pseudoresidual.
这个数据框中的列dat的pseudosum,,com的补偿和res的pseudoresidual,。

There is a plot method for this class. See fv.object.
有一个图,这个类的方法。见fv.object。


(作者)----------Author(s)----------



Adrian Baddeley
<a href="mailto:Adrian.Baddeley@csiro.au">Adrian.Baddeley@csiro.au</a>
<a href="http://www.maths.uwa.edu.au/~adrian/">http://www.maths.uwa.edu.au/~adrian/</a>
Ege Rubak and Jesper Moller.




参考文献----------References----------

Score, pseudo-score and residual diagnostics for spatial point process models. Statistical Science 26, 613&ndash;646.

参见----------See Also----------

Special cases: psstA, psstG.
特殊情况:psstA,psstG。

Alternative functions: Kres, Gres.
替代功能:Kres,Gres。


实例----------Examples----------


    data(cells)
    fit0 &lt;- ppm(cells, ~1) # uniform Poisson[统一的泊松]
   
    G0 <- psst(fit0, Gest)
    G0
    if(interactive()) plot(G0)

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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