R语言 beadarraySNP包 plotGoldenGate4OPA()函数中文帮助文档(中英文对照)

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plotGoldenGate4OPA(beadarraySNP)
plotGoldenGate4OPA()所属R语言包：beadarraySNP

                                        Plot Golden Gate genomic view
                                         图金门基因组视图

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Plots a full genome view based on 4 subsamples of Illumina Golden Gate data
绘制Illumina的金门数据根据4子样本的全基因组的看法


用法----------Usage----------


plotGoldenGate4OPA(object, cn.sum = NULL, sample = 1, plotRaw = FALSE, main = NULL, interact = FALSE, ...)
plotGenomePanels(object, cn.sum = NULL, sample = 1, plotRaw = FALSE, main = NULL, interact = FALSE, panels = list(p1 = c(1, 2, 3, 22), p2 = c(5, 6, 7, 8, 9), p3 = c(10, 11, 12, 13, 14, 15, 21), p4 = c(4, 16, 17, 18, 19, 20, 98, 99)), ...)



参数----------Arguments----------

参数：object
class SnpSetIllumina
类SnpSetIllumina


参数：cn.sum
list containing genomic states, see createCNSummary  
列表包含的基因状态，看到createCNSummary


参数：sample
identifier to select the sample within the object
标识符来选择样本内的对象


参数：plotRaw
logical, plot raw data points
逻辑，图的原始数据点


参数：main
character, Title of plot
性质，图标题


参数：interact
logical, plot should be usable for interactive copy number determination interactiveCNselect
逻辑，图应该是交互式拷贝数测定interactiveCNselect可用


参数：panels
list, vectors of chromosomes for each panel
列表，向量的染色体，每个小组


参数：...
extra arguments are formwarded to plot
额外的参数formwardedplot


Details

详情----------Details----------

prepare interactive selection
准备交互式选择


值----------Value----------

list, see createCNSummary
列表，请参阅createCNSummary


作者（S）----------Author(s)----------


Jan Oosting



参见----------See Also----------

segmentate, alterCN, interactiveCNselect createCNSummary
segmentate, alterCN, interactiveCNselect createCNSummary

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