R语言 beadarraySNP包 interactiveCNselect()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

interactiveCNselect(beadarraySNP)
interactiveCNselect()所属R语言包：beadarraySNP

                                         Interactive assignment of copynumbers to genomic segments
                                         互动转让copynumbers基因组片段

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function plots the genomic view of a sample, and allows the assignment of a discrete copy number to each segment
此功能图样本的基因组，并允许离散拷贝数的分配到各分部


用法----------Usage----------


interactiveCNselect(object, sample = 1, dnaIndex)



参数----------Arguments----------

参数：object
class SnpSetIllumina after segmentation
类SnpSetIllumina后分割


参数：sample
Sample identifier within object
样品标识内object


参数：dnaIndex
numeric, measured DNA index of the sample (1=normal)
数字，测量样品的DNA指数（1 =正常）


Details

详情----------Details----------

The user can interactively assign discrete, integer copy number values to each segment. This is done by either clicking in the lower part of a panel to decrease the copy number, or  in the higher part of a panel to increase the copy number. The order of copy number values is  always maintained; a segment with a lower raw value can not get a higher copy number assigned then a segment with a higher raw copy number value.
用户可以通过交互离散整数拷贝数值分配到各分部。这是通过点击下部的一个小组，以减少拷贝数，或在更高的面板部分增加拷贝数。拷贝数值的顺序始终保持与原料价值较低的部分不能得到较高的拷贝数，然后分配给具有较高的原始拷贝数值段。


值----------Value----------

list, see createCNSummary
列表，请参阅createCNSummary


作者（S）----------Author(s)----------


Jan Oosting



参见----------See Also----------

segmentate, alterCN, plotGoldenGate4OPA createCNSummary
segmentate, alterCN, plotGoldenGate4OPA createCNSummary

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注：
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