compareGenotypes(beadarraySNP)
compareGenotypes()所属R语言包：beadarraySNP
Compare genotypes
比较基因型
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Pairwise comparison of genotypes between unaffected and affected tissue from the same subject
成对比较同一主题的影响和受影响的组织之间的基因型
用法----------Usage----------
compareGenotypes(genotypeT, genotypeN)
参数----------Arguments----------
参数：genotypeT
character or logical vector, genotypes of affected tissue
字符或逻辑的向量，受影响组织的基因型
参数：genotypeN
character or logical vector with same length as genotypeT, genotypes of unaffected, normal tissue
字符或逻辑向量相同长度为genotypeT，不受影响，正常组织的基因型
Details
详情----------Details----------
Heterozygous probes have one the following values. TRUE, 'H' or 'AB'. All other values are considered homozygous. The primary purpose of the method is to find probes with loss of heterozygosity (LOH), where the unaffected probe is heterozygous and the affected is called homozygous.
杂合子的探针有一个下面的值。 TRUE，'H'或'AB'。所有其他值被认为是纯合子。该方法的主要目的是找到与杂合性缺失（LOH），其中未受影响的探针是杂合子和受影响的被称为合子的探针。
值----------Value----------
A vector with the same length as the arguments where each element can have one of four values
与参数相同长度的向量，其中每个元素可以有四个值之一
参数：'u'
Uninformative: both affected and normal are homozygous
无意义的：受影响的和正常的是纯合子
参数：'i'
Informative: both affected and unaffected heterozygous
信息：受影响和不受影响的杂合子
参数：'l'
Loss: unaffected heterozygous, affected homozygous
损失：不受影响杂合子，影响合子
参数：'a'
Artefact: unaffected homozygous, affected heterozygous
人工制品：不受影响合子，杂合子影响
作者（S）----------Author(s)----------
Jan Oosting
参见----------See Also----------
heterozygousSNPs
heterozygousSNPs
举例----------Examples----------
data(chr17.260)
compareGenotypes(exprs(chr17.260)[,"514TV"],exprs(chr17.260)[,"514NP"])
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发表于 2012-2-25 12:34:52
