R语言 beadarraySNP包 backgroundCorrect.SNP()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

backgroundCorrect.SNP(beadarraySNP)
backgroundCorrect.SNP()所属R语言包：beadarraySNP

                                        Background correction
                                         背景校正

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Perform background correction on Illumina Golden Gate bead arrays
Illumina的金门珠阵列上执行背景校正


用法----------Usage----------


   backgroundCorrect.SNP(object,method=c("none", "subtract", "half", "minimum",
                         "edwards", "normexp", "rma"),offset = 0)



参数----------Arguments----------

参数：object
SnpSetIllumina object
SnpSetIllumina对象


参数：method
character, method of correction
性格，矫正方法


参数：offset
numeric, constant to add after correction
数字，不断修正后添加


Details

详情----------Details----------

Code has been ported from the limma package. The matrices Gb and Rb should be available in the arrayData slot of the object.
limma包已经被移植的代码。矩阵Gb和Rb应该是arrayData对象插槽可用。


值----------Value----------

This function returns an SnpSetIllumina object with background  corrected values in the G and R.
这个函数返回一个SnpSetIllumina对象与背景值在G纠正和R。


作者（S）----------Author(s)----------


Jan Oosting, based on <code>limma</code> package by G. Smyth



参见----------See Also----------

SnpSetIllumina-class, backgroundCorrect,
SnpSetIllumina-class，backgroundCorrect

backgroundEstimate, normalizeBetweenAlleles.SNP, normalizeWithinArrays.SNP
backgroundEstimate，normalizeBetweenAlleles.SNP，normalizeWithinArrays.SNP


举例----------Examples----------


  ## Not run: data.bg&lt;-backgroundCorrect.SNP(data.raw,"subtract")[＃无法运行：data.bg <backgroundCorrect.SNP（data.raw，“减法”）]

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。