R语言 BayesPeak包 plot.PP()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

plot.PP(BayesPeak)
plot.PP()所属R语言包：BayesPeak

                                        Job PP plot.
                                         工作聚丙烯图。

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Plot the PP profile of a particular job.
画出PP某项工作的文件。


用法----------Usage----------


plot.PP(x, job, breaks = 150L, ...)



参数----------Arguments----------

参数：x
Raw output from the bayespeak function.  
从原料输出bayespeak功能。


参数：job
Integer. Which of the jobs in the output should have its PP values plotted?  
整数。在输出的工作应该具备哪些绘制的PP值？


参数：breaks
Integer. Analogous to the breaks argument in hist.  
整数。类似于在hist截断参数。


参数：...
Additional arguments passed to the hist function.  
额外的参数传递给hist函数。


Details

详情----------Details----------

plot.PP plots a histogram of the PP values returned in a particular BayesPeak job. This can be used to identify overfitting in a particular job. It is not suitable for identifying the prevalence of overfitting in all of the jobs in a genome-wide analysis - for that, please see plot.overfitdiag.
plot.PP图在特定BayesPeak作业返回的PP值的直方图。这可以用来确定在某一特定工作过拟合。它是不是适合所有的工作，在全基因组分析过拟合的患病率确定 - 因为这，请看到plot.overfitdiag。


值----------Value----------

Plots a histogram on the active graphical device.
绘制直方图上活跃的图形设备。


作者（S）----------Author(s)----------



Jonathan Cairns




参考文献----------References----------

BayesPeak: Bayesian analysis of ChIP-seq data, BMC Bioinformatics 2009, 10:299 doi:10.1186/1471-2105-10-299

参见----------See Also----------

bayespeak.
bayespeak。


举例----------Examples----------



##recreation of the plots in the vignette[＃休闲中的小插曲图]

data(raw.output) ##output from bayespeak()[＃从bayespeak输出（）]
plot.PP(raw.output, 324, ylim = c(0,50))
plot.PP(raw.output, 325, ylim = c(0,50))


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