MCdof(SpatialVx)
MCdof()所属R语言包：SpatialVx
Estimate the distribution of the proportion of spatial locations that contain significant correlations with randomly generated data
估计的比例包含显着的相关性与随机生成的数据的空间位置的分布
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Estimate the distribution of the proportion of spatial locations that contain significant correlations with randomly generated data along the lines of Livezey and Chen (1983).
估价的比例包含显着的相关性与随机产生的数据沿Livezey和Chen（1983）的线的空间位置的分布。
用法----------Usage----------
MCdof(x, ntrials = 5000, field.sig = 0.05, zfun = "rnorm", zfun.args = NULL, which.test = c("t", "Z", "cor.test"), verbose = FALSE, ...)
sig.cor.t(r, len = 40, ...)
sig.cor.Z(r, len = 40, H0 = 0)
fisherz(r)
参数----------Arguments----------
参数：x
n X m numeric matrix whose rows represent temporal points, and whose columns are spatial locations.
N×M的数字矩阵的行表示时间点，而其空间位置的列。
参数：ntrials
numeric/integer giving the number of times to generate random samples of size n, and correlate them with the columns of x.
数字/整数给予的次数，生成随机样品的大小为n，和关联他们的列x。
参数：field.sig
numeric between 0 and 1 giving the desired fields significance level.
数字0和1之间提供所需的字段的显着性水平。
参数：zfun
character naming a random number generator that takes n (the size of the sample to be drawn) as an argument, and any other arguments necessary.
字符命名n（样本的大小被提取）作为参数，必要的任何其他参数的随机数生成器，它。
参数：zfun.args
list object giving the values for additional arguments to the function named by zfun.
列表对象给予额外的参数的值的功能命名zfun。
参数：which.test
character naming which type of test to do (default, "t", is a t-test, calls sig.cor.t). "Z" does Fisher's Z transform (calls sig.cor.Z). "cor.test" calls cor.test giving more options, but is also considerably slower than "t" or "Z".
字符命名做哪种类型的测试（默认情况下，“T”，t检验，要求sig.cor.t“）。 “Z”Fisher的Z变换（检测sig.cor.Z）。 “cor.test”调用cor.test提供更多的选择，但也明显慢于“T”或“Z”。
参数：r
numeric giving the correlation value(s).
发出的相关值（s）的数字。
参数：len
numeric giving the size of the data for the test.
数字给出的测试数据的大小。
参数：H0
numeric giving the null hypothesis value (not used by MCdof).
数字的零假设值（不使用MCdof）。
参数：verbose
logical, should progress information (including total run time) be printed to the screen?
逻辑，应打印到屏幕上的信息（包括总运行时间）的进展吗？
参数：...
optional arguments to sig.cor.t (not used), sig.cor.Z, or cor.test depending on argument which.test.
可选参数sig.cor.t（未使用），sig.cor.Z或cor.test根据上的参数which.test。
Details
详细信息----------Details----------
This function does the Livezey and Chen (1983) Monte Carlo step 2 (a) from Elmore et al. (2006). It generates a random sample of size n, and finds the p-values of a correlation test with this random sample and each column of x. From this, it estimates the proportion of spatial locations that could contain significant bias purely by chance.
此功能的Livezey的和Chen（1983）蒙特卡洛步骤2（a）从埃尔莫尔等。 （2006年）。它会产生一个大小为n的随机样本，并发现这个随机抽样的相关测试和每一列的x的p值的。这一点，估计比例的空间位置，可能包含重大的偏差纯属偶然。
值----------Value----------
MCdof returns a list object with components:
MCdof返回一个列表对象的组件：
参数：MCprops
numeric vector of length ntrials giving the proportion of locations with significant bias found by chance for each repition of the experiment.
数字矢量的长度ntrials，给人的位置的机会为每个repition的实验发现的重大偏差的比例。
参数：minsigcov
single numeric giving the 1 - field.sig quantile of the resulting proportions given by MCprops.
单一的数字，1 - field.sig位数的比例由MCprops。
sig.cor.t and sig.cor.Z return umeric vectors of p-values, and fisherz returns a numeric vector of test statistics.
sig.cor.t和sig.cor.Z返回umeric的向量p-值，并返回一个数值向量fisherz的检验统计量。
（作者）----------Author(s)----------
Kimberly L. Elmore and Eric Gilleland
参考文献----------References----------
参见----------See Also----------
spatbiasFS, LocSig, cor.test, rnorm, runif, rexp, rgamma
spatbiasFS，LocSig，cor.test，rnorm，runif，rexp，rgamma
实例----------Examples----------
data(GFSNAMfcstEx)
data(GFSNAMobsEx)
data(GFSNAMlocEx)
id <- GFSNAMlocEx[,"Lon"] >=-100 & GFSNAMlocEx[,"Lon"] <= -75 & GFSNAMlocEx[,"Lat"] <= 36
look <- MCdof(GFSNAMfcstEx[,id] - GFSNAMobsEx[,id], ntrials=500)
stats(look$MCprops)
look$minsigcov
fisherz( abs(cor(rnorm(10),rexp(10), use="pairwise.complete.obs")))
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发表于 2012-9-30 12:57:32
