R语言 SpatialExtremes包 fitcopula()函数中文帮助文档(中英文对照)

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fitcopula(SpatialExtremes)
fitcopula()所属R语言包：SpatialExtremes

                                         Fit a copula-based model to spatial extremes
                                         Copula的模型适合对空间的极致

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function fits various copula-based models to spatial extremes data sets.
此功能适合不同的Copula函数为基础的模型空间极端的数据集。


用法----------Usage----------


fitcopula(data, coord, copula = "gaussian", cov.mod = "whitmat",
loc.form, scale.form, shape.form, marg.cov = NULL, temp.cov = NULL,
temp.form.loc = NULL, temp.form.scale = NULL, temp.form.shape = NULL,
..., start, control = list(maxit = 10000), method = "Nelder", std.err =
TRUE, warn = TRUE, corr = FALSE)



参数----------Arguments----------

参数：data
A matrix representing the data. Each column corresponds to one location.
矩阵表示数据。每一列对应于一个位置。


参数：coord
A matrix that gives the coordinates of each location. Each row corresponds to one location.
的矩阵，使每一个位置的坐标。每一行对应于一个位置。


参数：copula
A character string. Must be one of "gaussian" and "student" for a Gaussian and Student copula.
一个字符串。必须有一个“高斯”和“学生”的高斯和学生系词。


参数：cov.mod
A character string corresponding to the correlation function family used in the copula. Must be one of "whitmat", "cauchy", "powexp", "bessel" or "caugen" for the Whittle-Matern, the Cauchy, the Powered Exponential, the Bessel and the Generalized Cauchy correlation families.
相应的Copula函数中使用的相关函数族的一个字符串。必须一个“whitmat”，“柯西”中，“powexp”，“贝塞尔”或“caugen”的惠特尔的Matern，柯西，动力指数，贝塞尔和广义柯西相关的家庭。


参数：loc.form, scale.form, shape.form
R formulas defining the spatial linear model for the GEV parameters. May be missing. See section Details of function fitmaxstab.
ŕ公式定义空间的线性模型的GEV参数。可能会丢失。请参见功能fitmaxstab。


参数：marg.cov
Matrix with named columns giving additional covariates for the GEV parameters. If NULL, no extra covariates are used.
额外的协变量的GEV参数的指定列的矩阵。如果NULL，没有额外的协变量。


参数：temp.cov
Matrix with names columns giving additional *temporal* covariates for the GEV parameters. If NULL, no temporal trend are assume for the GEV parameters — see section Details of function fitmaxstab.
矩阵的列名提供额外的时间*协变量的GEV参数的。如果NULL，没有时间趋势的假设的GEV参数 - 看到部分功能fitmaxstab详情。


参数：temp.form.loc, temp.form.scale, temp.form.shape
R formulas defining the temporal trends for the GEV parameters. May be missing. See section Details of function fitmaxstab.
ŕ公式定义的GEV参数的变化趋势。可能会丢失。请参见功能fitmaxstab。


参数：...
Several arguments to be passed to the optim, nlm or nlminb functions.
几个参数被传递到optim，nlm或nlminb函数。


参数：start
A named list giving the initial values for the parameters over which the pairwise likelihood is to be minimized. If start is omitted the routine attempts to find good starting values - but might fail.
命名的列表，给出的参数成对的可能性是最小化的初始值。如果start省略的日常试图找到很好的起点值 - 但可能会失败。


参数：control
A list giving the control parameters to be passed to the optim function.
一个列表，给出的控制参数被传递到optim功能。


参数：method
The method used for the numerical optimisation procedure. Must be one of BFGS, Nelder-Mead, CG, L-BFGS-B, SANN, nlm or nlminb. See optim for details. Please note that passing nlm or nlminb will use the nlm or nlminb functions instead of optim.
所使用的方法的数值优化程序。必须有一个BFGS，Nelder-Mead，CG，L-BFGS-B，SANN，nlm或nlminb。见optim的详细信息。请注意，通过nlm或nlminb使用nlm或nlminb函数，而不是optim。


参数：std.err
Logical. Should the standard errors be computed ? The default is to return the standard errors, i.e.,  std.err =       TRUE.
逻辑。的标准误差计算？默认情况下返回的标准错误，即，std.err =       TRUE。


参数：warn
Logical. If TRUE (default), users are warned if the log-likelihood is infinite at starting values and/or problems arised while computing the standard errors.
逻辑。 TRUE如果（默认），用户都警告说，如果对数似然是无限的初始值和/或自行拆解的问题，同时计算标准的错误。


参数：corr
Logical. If TRUE (non default), the asymptotic correlation matrix is computed.
逻辑。如果TRUE（非默认）的渐近相关矩阵的计算。


值----------Value----------

This function returns a object of class copula.
这个函数返回一个对象类copula。


警告----------Warning----------

This function does not use max-stable copula and the use of non max-stable copula for modelling spatial extreme is highly questionable. This function was mainly implemented for educational purposes and not for concrete modelling purposes.
不使用此功能最大的稳定copula和使用非最大稳定Copula函数来模拟空间极端是非常值得怀疑的。此功能主要是实现教育目的，而不是具体的建模的目的。


（作者）----------Author(s)----------



Mathieu Ribatet




参考文献----------References----------

of Spatial Extremes. Submitted to Statistical Science.

参见----------See Also----------

fitmaxstab, latent
fitmaxstab，latent


实例----------Examples----------


## Not run: [＃不运行：]
n.site <- 30
n.obs <- 50

coord <- matrix(runif(2 * n.site, -10, 10), ncol = 2)
colnames(coord) <- c("lon", "lat")

## Generate data from a Gaussian copula model[＃生成一个的高斯Copula函数模型的数据。]
data <- rcopula(n.obs, coord, "gaussian", "powexp", nugget = 0, range = 4, smooth = 1.2)

## Transform the margins to GEV[＃变换的边缘GEV]
locs <- -5 + coord[,"lon"] / 10
scales <- 10 + coord[,"lat"] / 2
shapes <- rep(0.2, n.site)

for (i in 1:n.site)
  data[,i] <- frech2gev(data[,i], locs[i], scales[i], shapes[i])

## Fit a Gaussian copula model[＃符合高斯copula模型]

## 1. Define trend surfaces[＃1。定义趋势面]
loc.form <- y ~ lon
scale.form <- y ~ lat
shape.form <- y ~ 1

## 2. Fit[＃2。适合]
M0 <- fitcopula(data, coord, "gaussian", "powexp", loc.form, scale.form,
                shape.form, nugget = 0)

## End(Not run)[＃（不执行）]

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