calcRss(attract)
calcRss()所属R语言包:attract
Function calculates the average RSS for a set of cluster assignments.
函数计算一组聚类分配的平均RSS。
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Function calculates the average RSS for a set of cluster assignments.
函数计算一组聚类分配的平均RSS。
用法----------Usage----------
calcRss(exprs.dat, cl, class.vector)
参数----------Arguments----------
参数:exprs.dat
a matrix of gene expression values.
matrix基因的表达值。
参数:cl
a vector of cluster assignments.
vector聚类的任务。
参数:class.vector
a vector specifying the group membership of the samples.
vector指定样品的组成员。
Details
详情----------Details----------
This function is called internally by findSynexprs. For an informative cluster, the RSS values should be very small relative to those produced by the informativeness metric (the MSS values).
这个函数内部被称为findSynexprs。对于一个信息聚类,RSS值应该是很小的相对的信息量度量(MSS值)。
值----------Value----------
A numeric value representing the average RSS value for this set of cluster assignments.
一个数值代表的平均RSS这套聚类分配的价值。
作者(S)----------Author(s)----------
Jessica Mar
举例----------Examples----------
## Not run: [#无法运行:]
library(cluster)
data(subset.loring.eset)
clustObj <- agnes(as.dist(1-t(cor(exprs(subset.loring.eset)))))
crss.vals <- NULL
for( i in 1:10 ){
crss.vals <- c(crss.vals, calcRss(exprs(subset.loring.eset), cutree(clustObj,i), pData(subset.loring.eset)$celltype))
}
# The RSS values are expected to be smaller than the informativeness metric values in the presence of genuine cluster structure.[RSS值预计将超过度量值存在真正的聚类结构的信息量较小。]
## End(Not run)[#结束(不运行)]
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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