R语言 SPA3G包 SPA3G-package()函数中文帮助文档(中英文对照)

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SPA3G-package(SPA3G)
SPA3G-package()所属R语言包：SPA3G

                                         SPA3G               
                                         SPA3G

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

The package implements the model-based kernel machine method for detecting gene-centric gene-gene interactions of Li and Cui (2012).
包实现基于模型的内核机器方法，用于检测基因为中心的基因 - 基因相互作用李和崔（2012年）。


Details

详细信息----------Details----------

SPA3G conducts statistical test for overall genetic effects of a gene pair and interaction effect between them.  The overall test is conducted first and users can decide when to perform an interaction test by setting a cutoff value for the overall test p-value.  REML estimates of variance components can also be reported as required by users.   
SPA3G整体遗传的基因对它们之间的互作效应的影响进行了统计检验。先进行整体测试，用户可以决定何时执行一个互动的整体测试p值设置一个临界值的测试。 REML方差分量估计，也可根据用户需要。

To run SPA, appropriately prepared phenotype and genotype datasets are required. For the format of the input data sets, please run "data(SPA_example)"  after install the package.
要运行SPA，适当准备的表型和基因型数据集是必需的。对于格式的输入数据集，请运行“数据（SPA_example）”之后安装的软件包。


（作者）----------Author(s)----------



Shaoyu Li and Yuehua Cui

Shaoyu Li, shaoyu.li@stjude.org\
Yuehua Cui, cui@stt.msu.edu\
Erik Segur, segur@stt.msu.edu




参考文献----------References----------



实例----------Examples----------


data(SPA.example)
spam.res <- SPA(SPA.example$pheno, SPA.example$geno, g.size=c(1, 3), cutoff=1)
spam.res

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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