R语言 ArrayTools包 createIndex()函数中文帮助文档(中英文对照)

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createIndex(ArrayTools)
createIndex()所属R语言包：ArrayTools

                                        Creating an HTML index file
                                         创建一个HTML索引文件

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This HTML index file will link all the ouputted result, including Quality Assessment Report, differentially expressed genes, etc...
这个HTML索引文件将连接所有ouputted的结果，包括质量评估报告，差异表达基因，等等......


用法----------Usage----------


createIndex(..., mydir = getwd(), index.file = "index.html", createHeader = NULL)



参数----------Arguments----------

参数：...
regressionResults or interactionResult
regressionResults或interactionResult


参数：mydir
the directory to contain the index file  
包含索引文件的目录


参数：index.file
name of the index file  
索引文件的名称


参数：createHeader
If want to want to create an Header, such as your name, company names, etc...
如果要要创建头，如您的姓名，公司名称等......


值----------Value----------

creating an HTML index-file in your directory
在你的目录中创建一个HTML索引文件


作者（S）----------Author(s)----------


Xiwei Wu, Arthur Li



举例----------Examples----------


data(eSetExample)
design<- new("designMatrix", target=pData(eSetExample), covariates = "Treatment")
contrast<- new("contrastMatrix", design.matrix = design,
    compare1 = "Treated", compare2 = "Control")
result<- regress(eSetExample, contrast)
sigResult<- selectSigGene(result, fc.value=log2(2))
## Not run: Output2HTML(sigResult)[＃不运行：Output2HTML（sigResult）]

design.int<- new("designMatrix", target=pData(eSetExample), covariates = c("Treatment", "Group"),
    intIndex = c(1, 2))
contrast.int<- new("contrastMatrix", design.matrix = design.int, interaction=TRUE)
result.int<- regress(eSetExample, contrast.int)
sigResult.int <- selectSigGene(result.int)
intResult <- postInteraction(eSetExample, sigResult.int, mainVar ="Treatment",
   compare1 = "Treated", compare2 = "Control")
sigResultInt <- selectSigGeneInt(intResult)
## Not run: Output2HTML(sigResultInt)[＃不运行：Output2HTML（sigResultInt）]

## Not run: createIndex(sigResult, sigResultInt, createHeader = c("Arthur Li", "COH"))[＃无法运行的CreateIndex（sigResult，sigResultInt，createHeader = C（“李国章”，“取卵”））]

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。