readSpot(arrayQuality)
readSpot()所属R语言包:arrayQuality
Extraction of measures from Spot (.spot) files.
从现货措施(点)文件提取。
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This component reads a Spot file (.spot) and returns columns used for quality control.
此组件读取的现货文件(点),并返回用于质量控制的列。
用法----------Usage----------
readSpot(fnames = NULL, path= ".", galfile=NULL,DEBUG=FALSE, skip = 0, sep ="\t",quote="\"",controlId="ID", ...)
参数----------Arguments----------
参数:fnames
A "character" string naming the input file.
一个“字符”字符串,命名输入文件。
参数:path
a "character" string representing the data directory. By default this is set to the current working directory (".").
“字符”字符串表示的数据目录。默认情况下,这是设置为当前工作目录(“。”)。
参数:galfile
A "character" string naming the galfile associated with the input file. If galfile = NULL, readSpot will use the first .gal file found in the working directory.
一个“字”的字符串,命名与输入文件相关的galfile。如果galfile =空,readSpot将使用工作目录中发现的第一。加仑文件。
参数:DEBUG
If 'TRUE', debug statements are printed.
如果“TRUE”,打印调试语句。
参数:skip
Number of lines to skip in the gpr files.
在GPR文件跳过的行数。
参数:sep
A "character" string defining the type of separation for the columns in the gpr files.
一个“字符”字符串,定义为分离式列在GPR文件。
参数:quote
A "character" string defining the type of quote in the gpr files.
一个“字”的报价在GPR文件类型定义的字符串。
参数:controlId
Character string. Name of the column of the Spot file used to define controls.
字符串。现货文件用来定义控件的列名。
参数:...
additional arguments.
额外的参数。
值----------Value----------
A list of vectors containing information extracted from the
从向量中提取的信息列表
作者(S)----------Author(s)----------
Agnes Paquet
参见----------See Also----------
slideQuality, agQuality, globalQuality
slideQuality,agQuality,globalQuality
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