PRvQCHyb(arrayQuality)
PRvQCHyb()所属R语言包:arrayQuality
Print run Quality version Quality Control Hybridization
打印运行质量版本的质量控制杂交
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Qualitative diagnostic plots looking at print-run quality. This component examine the QC hybridizations.
定性诊断图寻找在印数品质。此组件检查QC杂交。
用法----------Usage----------
PRvQCHyb(fnames, path=".", dev = "png", DEBUG=FALSE, prargs=NULL, samepr=TRUE, prname="xMm", save = TRUE, col,...)
参数----------Arguments----------
参数:fnames
A "character" string naming the input files.
一个“字符”字符串,命名输入文件。
参数:path
a character string representing the data directory. By default this is set to the current working directory (".").
一个字符串,代表数据目录。默认情况下,这是设置为当前工作目录(“。”)。
参数:dev
A "character" string naming the graphics device. This will take arguments "png", "jpeg" and "ps" only.
一个“字符”字符串命名的图形设备。这将带参数的“PNG”,“JPEG”和“PS”只。
参数:DEBUG
If 'TRUE', debug statements are printed.
如果“TRUE”,打印调试语句。
参数:prargs
A list with 4 components: Block, Row, Column and ncolumns. See Details for more information.
4组件的列表:座,行,列和ncolumns。更多信息,请参阅。
参数:samepr
If 'TRUE', we assume everything in the directory are from the same print-run.
如果“TRUE”,我们假设目录中的一切都从相同的印数。
参数:prname
A "character" string giving the name of the print-run.
一个“字符”印数名称的字符串。
参数:save
If "TRUE", the figures will be saved to files.
如果“TRUE”,数字将被保存到文件。
参数:col
color code for different control samples.
不同的控制样品的颜色代码。
参数:...
additional arguments.
额外的参数。
Details
详情----------Details----------
The argument "prargs" is used to calculate the layout information about a print-run. Components Block, Row and Columns denote the column names from the input data representing the print-tip location. The component "ncolumns" is an integer representing the number of print-tip columns in the data. If the arguement is set to NULL, the the following default will be used. list(Block="Block", Row="Row", Column="Column", ncolumns=4)
参数“prargs”被用来计算约印数布局信息。组件块,行和列表示代表打印头的位置,从输入数据中的列名。组件“ncolumns”是一个整数,代表打印头中的数据列的数量。如果arguement设置为NULL,在下面的默认将被使用。列表(块=“块”,行=“行”,“列”列“,ncolumns = 4)
值----------Value----------
Files of diagnostic plots.
文件诊断图。
作者(S)----------Author(s)----------
Jean Yee Hwa Yang
举例----------Examples----------
datadir <- system.file("gprQCData", package="arrayQuality")
if (interactive())
PRvQCHyb(fnames="9Mm137.gpr", path=datadir, prname="9Mm")
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