R语言 SNPRelate包 snpgdsSNPListStrand()函数中文帮助文档(中英文对照)

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snpgdsSNPListStrand(SNPRelate)
snpgdsSNPListStrand()所属R语言包：SNPRelate

                                         Switch allele strand.
                                         切换等位基因链。

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

To get a logical vector, indicating whether allele references of snplist2 need to be switched, with respect to snplist1.
为了得到一个逻辑向量，指示是否等位基因参考文献snplist2需要切换，相对于到snplist1。


用法----------Usage----------


snpgdsSNPListStrand(snplist1, snplist2)



参数----------Arguments----------

参数：snplist1
the first SNP list object “snpgdsSNPListClass”
第一SNP列表对象“snpgdsSNPListClass”的


参数：snplist2
the second SNP list object “snpgdsSNPListClass”
第二个SNP列表对象“snpgdsSNPListClass”的


值----------Value----------

a logical vector, where TRUE indiciates the allele references need to be switched, and NA indiciates that locus is not in the common snp list.
逻辑向量，其中TRUE indiciates等位基因引用需要切换，和NA indiciates轨迹是不常见的SNP列表。


（作者）----------Author(s)----------


Xiuwen Zheng <a href="mailto:zhengx@u.washington.edu">zhengx@u.washington.edu</a>



参见----------See Also----------

snpgdsSNPList, snpgdsSNPListStrand
snpgdsSNPList，snpgdsSNPListStrand


实例----------Examples----------


# open an example dataset (HapMap)[打开示例数据集（人类基因组单体型图）]
genofile <- openfn.gds(snpgdsExampleFileName())

# to get a snp list object[获得SNP列表对象]
snplist1 <- snpgdsSNPList(genofile)
snplist2 <- snpgdsSNPList(genofile)

# a common snp list[一个常见的SNP列表]
L <- snpgdsSNPListStrand(snplist1, snplist2)

table(L, exclude=NULL)

# close the genotype file[关闭基因型文件]
closefn.gds(genofile)

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注：
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