transf.inter(SNPmaxsel)
transf.inter()所属R语言包:SNPmaxsel
Transforms a pair of SNPs into a single variable with nine categories
转换一对九类变量到一个单一的单核苷酸多态性
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
The function transf.inter creates a new variable with 9 categories out of a pair of variables with 3 categories (e.g. SNPs). The new variable is generated as described in Boulesteix et al (2007): =1 if x1=1 and x2=1, =2 if x1=2 and x2=1, =3 if x1=3 and x2=1, =4 if x1=1 and x2=2, =5 if x1=2 and x2=2, =6 if x1=3 and x2=2, =7 if x1=1 and x2=3, =8 if x1=2 and x2=3, =9 if x1=3 and x2=3.
函数transf.inter创建一个新的变量,9个类别,一对3个类别(如SNP)位点的变量。生成新的变量中所描述Boulesteix等人(2007):= 1如果x1 = 1和x2 = 1,= 2如果x1 = 2和x2 = 1,= 3如果x1 = 3和x2 = 1,= 4如果x1 = 1和x2 = 2,= 5×1 = 2和x2 = 2,= 6×1 = 3和x2 = 2,= 7×1 = 1和x2 = 3,= 8×1 = 2和X2 = 3,= 9如果x1 = 3和x2 = 3。
用法----------Usage----------
transf.inter(x1,x2)
参数----------Arguments----------
参数:x1
a numeric vector of length n giving the first SNP, coded as 1,2,3.
一个数值向量长度为n给人的第一单核苷酸多态性,编码为1,2,3。
参数:x2
a numeric vector of length n giving the second SNP, coded as 1,2,3.
一个数值向量长度为n的给第二个SNP位点,编码为1,2,3。
值----------Value----------
a numeric vector of length n containing the new variable with 9 categories.
一个数值向量长度为n的包含9个类别的新变量。
(作者)----------Author(s)----------
Anne-Laure Boulesteix (<a href="http://www.ibe.med.uni-muenchen.de/organisation/mitarbeiter/020_professuren/boulesteix/index.html">http://www.ibe.med.uni-muenchen.de/organisation/mitarbeiter/020_professuren/boulesteix/index.html</a>)
参考文献----------References----------
Boulesteix AL, Strobl C, Weidinger S, Wichmann HE, Wagenpfeil S, 2007. Multiple testing for SNP-SNP interactions. Statistical Applications in Genetics and Molecular Biology 6:37.
参见----------See Also----------
maxsel,maxsel.asymp.test.
maxsel,maxsel.asymp.test。
实例----------Examples----------
# load SNPmaxsel library[加载SNPmaxsel库]
# library(SNPmaxsel)[库(SNPmaxsel)]
x1<-sample(3,100,replace=TRUE)
x2<-sample(3,100,replace=TRUE)
transf.inter(x1,x2)
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