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R语言 SNPMaP.cdm包 GenomeWideSNP_5()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-9-30 11:10:43 | 显示全部楼层 |阅读模式
GenomeWideSNP_5(SNPMaP.cdm)
GenomeWideSNP_5()所属R语言包:SNPMaP.cdm

                                        cdm for the GenomeWideSNP\_5 microarray
                                         清洁发展机制的GenomeWideSNP \ _5芯片

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

A SNPMaP cdm for the Affymetrix GenomeWideSNP\_5 genotyping microarray.
ASNPMaPcdm的Affymetrix公司GenomeWideSNP的\ _5基因分型芯片。


用法----------Usage----------


GenomeWideSNP_5



格式----------Format----------

The format is:<br> List of 1<br> \$ four.probesist of 1<br> ..\$ perfect: int [1:440794, 1:8] 3594244 3674393 3884091 4063474 3431205 4588391 2636192 4345647 3459144 2686249 ...<br> .. ..- attr(*, "dimnames")=List of 2<br> .. .. ..\$ : chr [1:440794] "SNP\_A-1780520" "SNP\_A-1780618" "SNP\_A-1780632" "SNP\_A-1780654" ...<br> .. .. ..\$ : chr [1:8] "pma1" "pma2" "pma3" "pma4" ...
格式为:<BR>的名单的参考\ $ four.probes:列表的1 <BR> .. \完美的诠释[1:440794,1:8] 3594244 3674393 3884091 4063474 3431205 4588391 2636192 4345647 3459144 2686249 ...参考.. ..  -  ATTR(*,“dimnames”)= 2 <BR>列表.. .. .. \ $:字符1:440794]“SNP \ _A-1780520”SNP \ _A-1780618“SNP \ _A-1780632”SNP \ _A-1780654“参考.. .. \ $字符[1:8]“PMA1”PMA2“,”pma3“的”pma4“...


Details

详细信息----------Details----------

The cdm is used to identify the probesets in the 'raw' SNPMaP object derived from the microarray CELs, achieving a similar function to an Affymetrix CDF file, but faster because it is held in memory once loaded. The GenomeWideSNP\_5 cdm has has one set comprising 440794 probesets with four quartets.
cdm是用来识别probesets,在“原始”的SNPMaP来自芯片CEL的对象,Affymetrix的CDF文件实现类似的功能,但速度更快,因为它是保存在内存中,一旦加载。的GenomeWideSNP \ _5cdm有一个set由440794 probesets组成的四个四重奏。

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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