qqpval(SNPassoc)
qqpval()所属R语言包:SNPassoc
Functions for inspecting population substructure
检查人口下部结构的功能
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This function plots ranked observed p values against the corresponding expected p values in -log scale.
此函数曲线排名p值对相应的p值在对数刻度。
用法----------Usage----------
qqpval(p, pch=16, col=4, ...)
参数----------Arguments----------
参数:p
a vector of p values
的p值的矢量
参数:pch
symbol to use for points
符号用于点
参数:col
color for points
点颜色
参数:...
other plot arguments
其他图参数的
值----------Value----------
A plot
图
参见----------See Also----------
GenomicControl, WGassociation
GenomicControl,WGassociation
实例----------Examples----------
data(SNPs)
datSNP<-setupSNP(SNPs,6:40,sep="")
res<-scanWGassociation(casco,datSNP,model=c("do","re","log-add"))
# observed vs expected p values for recessive model[观察与预期隐性模型的p值]
qqpval(recessive(res))
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注:
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