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R语言 SNPassoc包 GenomicControl()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-9-30 11:07:36 | 显示全部楼层 |阅读模式
GenomicControl(SNPassoc)
GenomicControl()所属R语言包:SNPassoc

                                        Population substructure
                                         人口下部结构

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function estimates an inflation (or deflation) factor, lambda, as indicated in the paper by Devlin et al. (2001) and corrects the p-values using this factor.
此功能估计通货膨胀(或通货紧缩)的因素,λ的文件,如Devlin等人。 (2001)和校正使用此因子的p-值。


用法----------Usage----------


GenomicControl(x, snp.sel)



参数----------Arguments----------

参数:x
an object of class 'WGassociation'.
对象类的WGassociation。


参数:snp.sel
SNPs used to compute lambda. Not required.
单核苷酸多态性来计算的lambda。不是必需的。


Details

详细信息----------Details----------

This method is only valid for 2x2 tables. This means that the object of class 'WGassociation' might not have fitted the codominant model.
这种方法只适用于2x2表。这意味着该对象可能没有类别WGassociation嵌合的共显性模型。

See reference for further details.
为进一步详情,请参阅参考。


值----------Value----------

The same object of class 'WGassociation' where the p-values have been corrected for genomic control.
同一个对象类的WGassociation的基因组控制的p值已得到纠正。


参考文献----------References----------

Genetic Epidemiology (2001) 21:273-84

参见----------See Also----------

qqpval, WGassociation
qqpval,WGassociation


实例----------Examples----------



data(SNPs)
datSNP<-setupSNP(SNPs,6:40,sep="")
res<-scanWGassociation(casco,datSNP,model=c("do","re","log-add"))

# Genomic Control [基因控制]
resCorrected<-GenomicControl(res)
plot(resCorrected)


转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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