R语言 ArrayExpress包 queryAE()函数中文帮助文档(中英文对照)

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queryAE(ArrayExpress)
queryAE()所属R语言包：ArrayExpress

                                         XML query of the ArrayExpress repository
                                         XML查询的ArrayExpress库

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

queryAE queries the ArrayExpress database with keywords and give a dataframe with  ArrayExpress identifiers and related information, as an output.
queryAE查询关键字ArrayExpress数据库，并给予1 dataframe ArrayExpress标识及相关信息，为输出。


用法----------Usage----------


queryAE(keywords = NULL, species = NULL)



参数----------Arguments----------

参数：keywords
the keyword(s) of interest. To use several words, they must be separated by a "+" as shown in the examples.  
感兴趣的关键字（S）。使用多个单词，他们必须通过一个“+”分隔，如例子所示。


参数：species
the specie(s) of interest.
实物利益（S）。


值----------Value----------

A dataframe with all the ArrayExpress dataset  identifiers which correspond to the query in the first column.  The following columns contain information about these datasets,   such as the number of raw files, the number of data processed,   the release date on the database, the pubmed ID, the species,   the experiment design and the experimental factors.
A dataframe with all the ArrayExpress dataset  identifiers which correspond to the query in the first column.  The following columns contain information about these datasets,   such as the number of raw files, the number of data processed,   the release date on the database, the pubmed ID, the species,   the experiment design and the experimental factors.


作者（S）----------Author(s)----------



Audrey Kauffmann

Maintainer: <kauffmann@bergonie.org>  




参见----------See Also----------

ArrayExpress,
ArrayExpress


举例----------Examples----------


## To retrieve all the identifiers of pneumonia data sets[＃肺炎数据集检索所有的标识符]
pneumo = queryAE(keywords = "pneumonia")

## To retrieve all the identifiers of pneumonia data sets studied in human[＃要检索的所有标识符肺炎数据集在人类研究]
pneumoHS = queryAE(keywords = "pneumonia", species = "homo+sapiens")

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