R语言 smacof包 permtest()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

permtest(smacof)
permtest()所属R语言包：smacof

                                        SMACOF Jackknife
                                         SMACOF刀切

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

These methods perform a permutation test for a nonmetric symmetric SMACOF solution.
这些方法执行测试一个非测量的对称SMACOF解决方案的一个置换。


用法----------Usage----------


## S3 method for class 'smacofB'
permtest(object, nrep = 100, verbose = FALSE)

## S3 method for class 'smacofPerm'
plot(x, alpha = 0.05, main, xlab, ylab, ...)




参数----------Arguments----------

参数：object
Object of class "smacofB", i.e., an MDS solution from smacofSym()
对象类"smacofB"，即MDS解决方案，从smacofSym()的


参数：nrep
Number of permutations
的排列数


参数：verbose
If TRUE, intermediate stress is printed out
如果TRUE，中间主应力打印出来


参数：x
Object of class "smacofPerm"
对象的类"smacofPerm"


参数：alpha
Alpha level
阿尔法层次


参数：main
Plot title.
图称号。


参数：xlab
Label of x-axis.
标签的x轴。


参数：ylab
Label of y-axis.
出版商的y轴。


参数：...
Further plot arguments passed: see plot for detailed information.
进一步的图传递的参数：见plot的详细信息。


Details

详细信息----------Details----------

This routine permutes m dissimilarity values, where m is the number of lower diagonal elements in the corresponding dissimilarity matrix. For each sample a symmetric, nonmetric SMACOF of dimension ndim is computed and the stress values are stored in stressvec. Using the fitted stress value, the p-value is computed. Subsequently, the empirical cumulative distribution function can be plotted using the plot method.
此例程置换米相异值，其中m是低级相应的相异矩阵中对角线元素的数目。对于每个样品的对称，非度量SMACOF的维度ndim的应力值被计算并存储在stressvec。使用拟合的应力值，计算p-值。随后，经验的累积分布函数可以使用绘图方法绘制。


值----------Value----------


参数：stressvec
Vector containing the stress values of the permutation samples
Vector，其中包含的置换样品的应力值


参数：stress.nm
Fitted nonmetric stress
配有非测量压力


参数：pval
Resulting P-values
得到的P值


参数：call
Model call
模型调用


参数：nrep
Number of permutations
的排列数


参数：nobj
Number of objects
对象的数量


（作者）----------Author(s)----------


Jan de Leeuw and Patrick Mair



参考文献----------References----------



参见----------See Also----------

jackknife.smacofB, smacofSym, plot.smacof
jackknife.smacofB，smacofSym，plot.smacof


实例----------Examples----------



## symmetric smacof[＃对称smacof]
data(kinshipdelta)
res.smacof <- smacofSym(kinshipdelta, ndim = 1, metric = FALSE)
res.perm <- permtest(res.smacof, verbose = TRUE)
res.perm

plot(res.perm)

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