R语言 apComplex包 sortComplexes()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

sortComplexes(apComplex)
sortComplexes()所属R语言包：apComplex

                                        Sort complex estimates
                                         复杂的估计数排序

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Sorts complexes recorded in PCMG list into three separate lists containing MBME, SBMH, and UnRBB complexes.
各种在PCMG列表分为三个单独列出包含MBME，SBMH，和UnRBB络合物络合物记录。


用法----------Usage----------


sortComplexes(PCMG, adjMat)



参数----------Arguments----------

参数：PCMG
Current PCMG estimate
当前PCMG估计


参数：adjMat
Adjacency matrix of bait-hit data from an AP-MS experiment.  Rows correspond to baits and columns to hits.
诱饵命中从一个AP-MS实验数据的邻接矩阵。行对应到点击的诱饵和列。


Details

详情----------Details----------

MBME complexes contain multiple bait proteins and multiple edges.  SBMH complexes contain one bait and a collection of hit-only proteins.  UnRBB complexes contain only two baits (no hit-only proteins) that are connected by an unreciprocated edge.
MBME络合物包含多个诱饵蛋白和多个边缘。 SBMH复合体包含一个诱饵，仅命中蛋白质的集合。 UnRBB络合物包含只有两个诱饵（没有命中唯一的蛋白质），由unreciprocated边缘连接。


值----------Value----------

A list of lists representing the MBME, SBMH, and UnRBB complex estimates.
代表的MBME，SBMH，并UnRBB的复杂估计列出列表。


作者（S）----------Author(s)----------


Denise Scholtens



参考文献----------References----------

interaction data.  Statistical Applications in Genetics and Molecular Biology 3, Article 39 (2004).
networks.  Bioinformatics 21, 3548-3557 (2005).

参见----------See Also----------

findComplexes
findComplexes


举例----------Examples----------



data(apEX)
PCMG2 <- findComplexes(apEX,sensitivity=.7,specificity=.75)
sortComplexes(PCMG2,apEX)


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