R语言 apComplex包 HMSPCI()函数中文帮助文档(中英文对照)

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HMSPCI(apComplex)
HMSPCI()所属R语言包：apComplex

                                        High-Throughput Mass Spectromic Protein Complex Identification (HMS-PCI) Data from Ho, et al. (2002)
                                         高通量的质谱Spectromic蛋白复合物识别（HMS的PCI）数据来自何，等。 （2002年）

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

HMS-PCI data published by Ho, et al. (2002).
HMS的PCI公布的数据由何，等。 （2002年）。


用法----------Usage----------


data(HMSPCI)
data(HMSPCIgraph)



Details

详情----------Details----------

HMSPCI is a matrix of the HMS-PCI data published by Ho, et al. (2002). The 493 rows correspond to bait proteins and the 1578 columns correspond to proteins found as hits in the HMSPCI experiment and are named accordingly. The first 493 column names are the same as the 493 row names; bait proteins can also be found as hits by other baits, hence their inclusion as columns in HMSPCI.  An entry of "1" in the ith row and jth column of HMSPCI indicates that bait protein i found protein j as a hit.  All other entries are "0".  There are a total of 3687 "1" entries in the matrix, corresponding to the 3687 comemberships detected in the experiment.
HMSPCI是何等发表的HMS PCI数据矩阵。 （2002年）。 493行对应诱饵蛋白和1578列对应作为命中在HMSPCI实验中发现的蛋白质，并命名为相应。第一个493列名493行名称相同;作为诱饵蛋白也可以点击其他诱饵，因此其作为列入HMSPCI列。 HMSPCI在第i行第j列的“1”的条目，我发现蛋白作为一击j表明，诱饵蛋白。所有其他项目均为“0”。有3687“1”条目中的矩阵，相应的检测实验中的3687 comemberships。

HMSPCIgraph is a graphNEL object in which 1578 nodes represent proteins and 3687 directed edges represent comemberships detected in the purification.  Each directed edge originates at the bait and ends at the hit.  Each edge in HMSPCIgraph corresponds to an entry of "1" in the HMSPCI matrix.
HMSPCIgraph是graphNEL对象，其中1578节点代表蛋白质和3687有向边代表在净化检测comemberships。每个导演的边缘，起源于诱饵和命中结束。每个HMSPCIgraph边缘对应进入HMSPCI矩阵中“1”。

These data are available at http://www.mdsp.com/yeast.
这些数据是在http://www.mdsp.com/yeast。


源----------Source----------

Ho, et al.  Systematic identification of protein complexes in Saccharomyces cerevisiae by mass spectrometry.  Nature 415, 180-183 (2002).
何，等。识别系统在酿酒酵母中的蛋白质复合物的质谱。自然保护区415，180-183（2002）。


参考文献----------References----------

interaction data.  Statistical Applications in Genetics and Molecular Biology 3, Article 39 (2004).
networks.  Bioinformatics 21, 3548-3557 (2005).

参见----------See Also----------

MBMEcHMSPCI,SBMHcHMSPCI,UnRBBcHMSPCI,TAP
MBMEcHMSPCI，SBMHcHMSPCI，UnRBBcHMSPCI，TAP


举例----------Examples----------


data(HMSPCI)
which(HMSPCI["YAL015C",]==1)

data(HMSPCIgraph)
adj(HMSPCIgraph,"YAL015C")

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