SKAT.SSD.All(SKAT)
SKAT.SSD.All()所属R语言包:SKAT
SNP-set Kernel Association Test
SNP设置内核协会测试
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Iteratively conduct association tests with phenotypes and SNP sets in SSD file.
迭代的表型和SNP套在SSD文件进行关联测试。
用法----------Usage----------
SKAT.SSD.All(SSD.INFO, obj, ...)
参数----------Arguments----------
参数:SSD.INFO
an SSD_INFO object returned from Open_SSD.
的SSD_INFO返回的对象Open_SSD。
参数:obj
an output object of the SKAT_Null_Model function.
一个输出对象的SKAT_Null_Model功能。
参数:...
furthuer arguments to be passed to “SKAT”.
furthuer参数被传递到“SKAT”。
Details
详细信息----------Details----------
Please see SKAT for details.
的详细信息,请参阅SKAT。
值----------Value----------
参数:results
the dataframe that contains SetID, p-values (P.value), the number of markers in the SNP sets (N.Marker.All), and the number of markers to test for an association after excluding non-polymorphic or high missing rates markers (N.Marker.Test).
包含SETID,p-值(P.value)的数据框,在SNP集(N.Marker.All)的标记物的数量,以及有多少的标记不含非多晶型或高的丢失率,测试后的关联标记(N.Marker.Test)。
参数:P.value.Resampling
the matrix that contains p-values of resampled phenotypes.
的矩阵,该矩阵包含重新采样的表型的p-值。
(作者)----------Author(s)----------
Seunggeun Lee
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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