R语言 SIN包 getgraph()函数中文帮助文档(中英文对照)

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getgraph(SIN)
getgraph()所属R语言包：SIN

                                        Obtain graph from simultaneous p-values
                                         同时p-值获取图

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function converts a matrix of simultaneous p-values into a graph by comparing the p-values to a user-provided significance level.
这个函数转换成的曲线图进行比较，一个用户提供的显着性水平的p值矩阵，同时p-值。


用法----------Usage----------


getgraph(pvals, alpha, type="UG", blocks=NULL)



参数----------Arguments----------

参数：pvals
a matrix of simultaneous p-values.
同时p-值的矩阵。


参数：alpha
a significance level, i.e., alpha in (0,1).
显着性水平，即，α-（0,1）中。


参数：type
a string specifying the type of graph that should be obtained from the p-value matrix. If type equals "UG" then an undirected graph is returned, if type equals "DAG" then an acyclic directed graph is returned, and if type equals "BG" then a bidirected graph is returned.  If type equals the fourth possible choice "CG" then a chain graph is returned, in which case a list of integer vectors has to be provided as the input blocks.
一个字符串，指定应获得的p-值矩阵的图形类型。如果type等于"UG"然后返回一个无向图，如果type等于"DAG"无环图被返回，如果type等于"BG"然后一个bidirected的图形，则返回。如果类型等于第四个可能的选择"CG"然后链图返回整数向量的列表，在这种情况下，要提供作为输入blocks。


参数：blocks
a list of integer vectors specifying a family of subsets of the variables.
指定的变量的子集的一个家庭的整数向量的列表。


值----------Value----------

The function returns an adjacency matrix A with A[i,j]=0 if there is no edge between vertices (variables) i and j. The convention for edges is that i-j if and only if A[i,j]=A[j,i]=1, i->j if and only if A[i,j]=1 and A[j,i]=0, and i<->j  if and only if A[i,j]=A[j,i]=2.
该函数返回一个邻接矩阵AA[i,j]=0，如果不存在边缘顶点之间（变量）i和j。 i-j当且仅当A[i,j]=A[j,i]=1，i->j当且仅当A[i,j]=1和A[j,i]=0和i<->j，如果和边缘的约定只有A[i,j]=A[j,i]=2。


实例----------Examples----------


data(fowlbones)
pvals <- sinUG(fowlbones$corr,fowlbones$n)
alpha <- 0.2
## get undirected graph[＃无向图]
getgraph(pvals, alpha, type="UG")
## forget that we used sinUG and get acyclic directed graph[＃忘记，我们使用sinUG并获得无环图]
getgraph(pvals, alpha, type="DAG")
## forget that we used sinUG and get bidirected graph[＃忘记，我们使用sinUG，并得到bidirected图]
getgraph(pvals, alpha, type="BG")
## forget that we used sinUG and get chain graph[＃忘记，我们使用的sinUG和链图]
myblocks <- list(1:2,3:4,5:6)
getgraph(pvals, alpha, type="CG", blocks=myblocks)

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