R语言 AnnotationFuncs包 pickGO()函数中文帮助文档(中英文对照)

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pickGO(AnnotationFuncs)
pickGO()所属R语言包：AnnotationFuncs

                                        Cleans up result from org...
                                         清理结果从ORG ...

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Cleans up result from org.Xx.egGO and returns specific GO identifiers
清理从org.Xx.egGO的结果，并返回特定的GO标识符


用法----------Usage----------


pickGO(l, evidence=NA, category=NA)



参数----------Arguments----------

参数：l
Character vector, or list of, og GO identifiers.
矢量字符，或列表，OG好标识符。


参数：evidence
Character vector, filters on which kind of evidence to return; for a larger list see getEvidenceCodes. \* Evidence codes may be: c('IMP','IGI','IPI','ISS','IDA','IEP','IEA','TAS','NAS','ND','IC'). \* Leave as NA to ignore filtering on this part.
特征向量，哪种证据返回过滤器;为一个较大的列表，请参阅getEvidenceCodes。 \ *证据的代码可能是：c('IMP','IGI','IPI','ISS','IDA','IEP','IEA','TAS','NAS','ND','IC')。 \ *离开NA忽略这部分的过滤。


参数：category
Character vector, filters on which ontology to return: biological process (BP), cellular component (CC), or molecular function (MF). \* Leave as NA to ignore filtering on this part. </table>
特征向量，其中本体过滤器返回：生物过程（BP），蜂窝组件（CC），或分子功能（MF）。 \ *离开NA忽略这部分的过滤。 </ TABLE>


Details

详情----------Details----------

Cleans up result from org.Xx.egGO and returns GO identifier for  either biological process (BP), cellular component (CC), or molecular function (MF).   Can be used on list of GOs from translate, or a single list of GOs from an annotation package.  
清理从org.Xx.egGO结果，并返回去标识或者生物过程（BP），蜂窝组件（CC），或分子功能（MF）。可用于GOS translate，或单从一个注解包GOS名单列表。


值----------Value----------

List with only the picked elements.
列出仅在采摘的元素。


作者（S）----------Author(s)----------


Stefan McKinnon Edwards <a href="mailto:stefan.hoj-edwards@agrsci.dk">stefan.hoj-edwards@agrsci.dk</a>



参见----------See Also----------

pickRefSeq, getEvidenceCodes, translate
pickRefSeq，getEvidenceCodes，translate


举例----------Examples----------


genes <- c(280705, 280706, 100327208)
GO <- translate(genes, org.Bt.egGO)
# Get all biological processes:[让所有的生物过程：]
pickGO(GO, category='BP')
# Get all ontologies with experimental evidence:[获取所有的实验证据本体：]

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