R语言 simone包 getNetwork()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

getNetwork(simone)
getNetwork()所属R语言包：simone

                                        Network extraction from a SIMoNe run
                                         从西蒙娜运行的网络提取

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

When running simone, a family of networks is generated and one may want to pick one of them according to a given
当运行simone，家庭网络的产生，可能要选择其中之一，根据给定的


用法----------Usage----------


getNetwork(object,
           selection = length(object$clusters),



参数----------Arguments----------

参数：object
output of a SIMoNe run (must be an object of class  simone)
输出的西蒙娜运行（必须是一个类的对象simone）


参数：selection
either a character string ("BIC" or "AIC") or an integer (a number of edges) that specifies how the network is selected from the list generated by simone. When a number num of edges is specified, the network is extracted by picking from the list the network with at most num edges. The effective number num will be displayed. Default is to extract a number of edges at most equal to the number of variables.
一个字符的字符串（"BIC"或"AIC"）或（边数）的整数，用于指定网络是如何生成的simone从列表中选择的。当一个数num的边缘被指定时，网络通过拾取从列表中的网络与至多num边缘提取。有效的数字num将被显示。缺省情况是将提取的边数最多的变量的数量相等。


参数：nodes
a vector of character string or integers used to extract a sub-part of the selected network, which can be more readable. When NULL (the default), all the variables are kept.
用于提取的子部分的选定的网络，它可以是更可读的字符串或整数的向量。当NULL（默认值），所有变量都被保留。


值----------Value----------

Returns an object of class simone.network, see rNetwork for further details.
返回一个对象的类simone.network，看到rNetwork的进一步详情。


（作者）----------Author(s)----------


J. Chiquet



参见----------See Also----------

simone, rNetwork, plot.simone.network.
simone，rNetwork，plot.simone.network。


实例----------Examples----------


## load the breast cancer data set[＃加载乳腺癌数据集]
data(cancer)
attach(cancer)

## launch SIMoNe on the full data set[＃完整的数据集上推出西蒙娜]
res <- simone(expr)

## the default selected network (at most p edges)[＃默认选中的网络（最p条边）]
plot(getNetwork(res))

## a sub network on some 10 randomly selected genes[＃子网络上的一些随机选取10个基因]
plot(getNetwork(res,"BIC", nodes = sample(colnames(expr),10)))

## a network with a penalty corresponding to at most 40 edges[＃罚款至多40边缘相对应的一个网络]
plot(getNetwork(res, 40))

detach(cancer)

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。