R语言 SimHap包 summary.snpClogit()函数中文帮助文档(中英文对照)

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summary.snpClogit(SimHap)
summary.snpClogit()所属R语言包：SimHap

                                        Summarizing Single SNP analysis models for matched case-control data
                                         单核苷酸多态性分析模型匹配的情况下，控制数据综述

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Summary method for objects of class snpClogit
摘要方法的类的对象的snpClogit


用法----------Usage----------


## S3 method for class 'snpClogit'
summary(object, ...)
## S3 method for class 'summary.snpClogit'
print(x, digits = max(3, getOption("digits") - 3),
        signif.stars = getOption("show.signif.stars"), ...)



参数----------Arguments----------

参数：object
an object of class snpClogit
一个对象的类snpClogit


参数：x
an object of class summary.snpClogit, the result of a call to  <PRE>summary.snpClogit.</PRE>
类的一个对象summary.snpClogit，结果的调用<PRE> summary.snpClogit。</ PRE>


参数：digits
the number of significant digits to use when printing.
打印时所使用的数量显著数字。


参数：signif.stars
logical. If TRUE, &ldquo;significance stars" are printed for each coefficient.
逻辑。如果TRUE，“意义明星”打印每个系数。


参数：...
further arguments passed to or from other methods.
进一步的参数传递给其他方法。


值----------Value----------

summary.snpClogit returns an object of class summary.snpClogit, a list with components
summary.snpClogit返回一个对象，组件类summary.snpClogit“的列表


参数：terms
terms attribute of formula1 called in snp.cc.match.
条款属性的公式叫snp.cc.match。


参数：coefficients
summarized results from fitted model, including odds ratios and p-values.
从拟合模型的汇总结果，包括比值比和p-值。


参数：formula
formula1 used in snp.cc.match.
formula1在snp.cc.match使用。


参数：LRT
likelihood ratio test comparing the model with SNP variables compared to the model without SNPs.
似然比检验比较模型相比，模型，而不单核苷酸多态性SNP变量。


参数：Wald
Wald statistic for the fitted model.
Wald统计量的拟合模型。


参数：rsquared
adjusted r-squared values for the fitted model.
调整后的R平方值的拟合模型。


参数：residuals
the residuals, that is response minus fitted values.
残差，，是响应减去拟合值。


（作者）----------Author(s)----------


Pamela A. McCaskie



参考文献----------References----------



参见----------See Also----------

snp.cc.match
snp.cc.match


实例----------Examples----------



data(SNP.dat)

# convert SNP.dat to format required by snp.cc.match[SNP.dat转换，格式化所需的snp.cc.match]
geno.dat <- SNP2Geno(SNP.dat, baseline=c("MM", "11", "GG", "CC"))

data(pheno.dat)
mymodel <- snp.cc.match(formula1=DISEASE~SBP+DBP+SNP_1_add+strata(STRAT),
        formula2=DISEASE~SBP+DBP+strata(STRAT), pheno=pheno.dat,
        geno=geno.dat)
summary(mymodel)


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