R语言 SimHap包 SNPlong.dat()函数中文帮助文档(中英文对照)

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SNPlong.dat(SimHap)
SNPlong.dat()所属R语言包：SimHap

                                        Example genotypic data for longitudinal analysis
                                         例基因型数据的纵向分析

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

SNPlong.dat is an example genotypic data set containing single nucleotide polymorphism (SNP) genotypes for use with snp.long and haplo.long
SNPlong.dat是一个例子基因型数据集，其中包含单核苷酸多态性（SNP）的基因型为使用snp.long和haplo.long


用法----------Usage----------


data(SNPlong.dat)



格式----------Format----------

A data frame with 99 observations on the following 4 variables.
一种数据框与99上的以下4个变量的观察。




ID patient identifier.
ID病人的标识符。




SNP_1 a SNP vector containing biallelic SNP genotypes.
SNP_1一个的SNP向量双等位基因的SNP基因型。




SNP_2 a SNP vector containing biallelic SNP genotypes.
SNP_2一个的SNP向量双等位基因的SNP基因型。




SNP_3 a SNP vector containing biallelic SNP genotypes.
SNP_3一个的SNP向量双等位基因的SNP基因型。


Details

详细信息----------Details----------

Simulated SNP data for use with longPheno.dat
模拟SNP的数据使用longPheno.dat


实例----------Examples----------



data(SNPlong.dat)

# transforms SNPlong.dat to an object containing 3 columns[转换到一个对象，它包含3列的SNPlong.dat]
# per SNP - additive, dominant and recessive, where genotypes[每个SNP  - 添加剂，显性和隐性的，其中基因型]
# defined in 'baseline' serve as the baseline genotypes[中定义的“基线”作为基线基因型]
longGeno.dat <- SNP2Geno(SNPlong.dat, baseline=c("AA", "GG", "V2V2"))

data(longPheno.dat)
mymodel <- snp.long(fixed=fev1f~SNP_1_add, random=~1|ID,
        geno=longGeno.dat, pheno=longPheno.dat, form=~year|ID)
summary(mymodel)


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