R语言 AnnotationDbi包 AnnDbPkg-maker()函数中文帮助文档(中英文对照)

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AnnDbPkg-maker(AnnotationDbi)
AnnDbPkg-maker()所属R语言包：AnnotationDbi

                                        Creates an SQLite-based annotation package
                                         创建一个SQLite为基础的注解包

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Creates an SQLite-based annotation package from an SQLite file.
SQLite文件，创建一个SQLite为基础的注解包。


用法----------Usage----------


  makeAnnDbPkg(x, dbfile, dest_dir=".", no.man=FALSE, ...)
  loadAnnDbPkgIndex(file)



参数----------Arguments----------

参数：x
A AnnDbPkgSeed object, a list, a string or a regular expression.  
一个AnnDbPkgSeed对象，列表，字符串或正则表达式。


参数：dbfile
The path to the SQLite containing the annotation data for the package to build.  
SQLite的路径包含注释数据包建立。


参数：dest_dir
The directory where the package will be created.  
包将创建的目录。


参数：file
The path to a DCF file containing the list of annotation packages to build.  
到DCF文件的建立注释软件包列表包含的路径。


参数：no.man
If TRUE then no man page is included in the package.  
如果TRUE再没有人页包中包含。


参数：...
Extra args used for extra filtering.  
额外ARGS用于额外的过滤。


参见----------See Also----------

AnnDbPkg-checker
AnnDbPkg检查器


举例----------Examples----------


  ## With a "AnnDbPkgSeed" object:[＃“AnnDbPkgSeed”对象：]
  seed <- new("AnnDbPkgSeed",
      Package="hgu133a2.db",
      Version="0.0.99",
      PkgTemplate="HUMANCHIP.DB",
      AnnObjPrefix="hgu133a2"
  )
  if (FALSE)
      makeAnnDbPkg(seed, "path/to/hgu133a2.sqlite")

  ## With package names:[＃包名：]
  ## (Note that in this case makeAnnDbPkg() will use the package descriptions[＃（请注意，在这种情况下，makeAnnDbPkg（）将使用的软件包描述]
  ## found in the master index file ANNDBPKG-INDEX.TXT located in the[＃发现在主索引文件在位于ANNDBPKG看到index.txt]
  ## AnnotationDbi package.)[＃AnnotationDbi包。）]
  if (FALSE)
      makeAnnDbPkg(c("hgu95av2.db", "hgu133a2.db"))

  ## A character vector of length 1 is treated as a regular expression:[＃一个长度为1的特征向量被视为一个正则表达式：]
  if (FALSE)
      makeAnnDbPkg("hgu.*")
  ## To make all the packages described in the master index:[＃为了使主索引中所描述的所有软件包：]
  if (FALSE)
      makeAnnDbPkg("")
  ## Extra args can be used to narrow down the roaster of packages to make:[＃额外args可以用来缩小使焙烧炉包：]
  if (FALSE) {
      makeAnnDbPkg("", PkgTemplate="HUMANCHIP.DB", manufacturer="Affymetrix")
      makeAnnDbPkg(".*[3k]\\.db", species=c("Mouse", "Rat"))
  }

  ## The master index file ANNDBPKG-INDEX.TXT can be loaded with:[＃主索引的文件ANNDBPKG，看到index.txt可装载：]
  loadAnnDbPkgIndex()

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