R语言 annotate包 setRepository()函数中文帮助文档(中英文对照)

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setRepository(annotate)
setRepository()所属R语言包：annotate

                                        Functions to add arbitrary repositories
                                         功能添加任意的库

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

These functions allow end users to add arbitrary repositories for use with the htmlpage function.
这些功能允许最终用户添加任意库与htmlpage功能使用。


用法----------Usage----------


setRepository(repository, FUN, ..., verbose=TRUE)
getRepositories()
clearRepository(repository, verbose=TRUE)



参数----------Arguments----------

参数：repository
A character name for the repository.
一个仓库字符的名称。


参数：FUN
A function to build hyperlinks for the repository. See details for more information.
函数，以建立资料库中的超链接。详情请参阅更多信息。


参数：...
Allows one to pass arbitrary code to underlying functions.
允许一个人通过基本功能任意代码。


参数：verbose
Output warning messages?
输出警告消息？


Details

详情----------Details----------

These functions allow end users to add, view, and remove repositories for use with the htmlpage function. getRepositories will output a vector of names for available repositories. clearRepository can be used to remove a repository if so desired. setRepository can be used to add a repository. See the examples section for the format of the FUN argument.
这些功能允许最终用户添加，查看，删除使用htmlpage函数库。 getRepositories将输出一个可用库名的向量。 clearRepository可以用来删除一个库，如果需要的话。 setRepository可以用来添加一个仓库。看到的乐趣参数的格式的例子。

Once a new repository has been set, the htmlpage function can be called using the name of the new repository as a value in the repository argument (e.g., htmlpage(<other args>, repository = list("newrepositoryname"))
一旦一个新的仓库已定，htmlpage函数可以被称为使用的新资料库的名称作为一个库中的参数值（例如，htmlpage（库=列表<其他args>，（“newrepositoryname” ;)）


作者（S）----------Author(s)----------


Martin Morgan &lt;mtmorgan@fhcrc.org&gt;



举例----------Examples----------



## A simple fake URI[＃一个简单的假的URI]
repofun <- function(ids, ...)
paste("http://www.afakeuri.com/", ids, sep = "")

setRepository("simple", repofun)

## More complicated, we want to make sure that[＃更复杂的，我们要确保]
## NAs get converted to empty cells[＃定居地转化为空单元格]

repofun <- function(ids, ...){
bIDs <- which(is.na(ids))
out <- paste("http://www.afakeuri.com/", ids, sep = "")
out[bIDs] <- "&amp;nbsp;"
out
}

setRepository("complex", repofun)

## More complicated URI where we need to pass more information[＃更复杂的URI的地方，我们需要传递更多的信息]
## An example is Ensembl, which requires a species as part of the URI[＃一个例子是Ensembl的，这就要求作为URI的一部分，一个物种]
## Since htmlpage() has an '...' argument, we can pass arbitrary[＃，由于htmlpage（）有一个“...”参数，我们可以通过任意]
## arguments to this function that will be passed down to our[＃此功能将传递到我们的论点]
## repfun. Here we assume the argument species="Homo_sapiens" has been[＃repfun。在这里，我们假设参数物种=“Homo_sapiens的”一直]
## included in the call to htmlpage().[＃包括在通话到htmlpage（）。]


repofun <- function(ids, ...){
if(!is.null(list(...)$species))
      species <- list(...)$species
  else
      stop("To make links for Ensembl, you need to pass a 'species' argument.",
           call. = FALSE)
out <- paste("http://www.ensembl.org/", species, "/Search/Summary?species=",
              species, ";idx=;q=", ids, sep = "")
out
}

setRepository("species_arg", repofun)


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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。