R语言 annotate包 pubmed()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

pubmed(annotate)
pubmed()所属R语言包：annotate

                                        A function to open the browser to Pubmed with the selected gene.
                                         函数打开浏览器，医学与选定的基因。

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Given a vector of Pubmed identifiers or accession numbers, the user can either have a browser display a URL showing a Pubmed query for those identifiers, or a XMLdoc object with the same data.
鉴于医学标识符或加入号码的向量，用户可以有一个浏览器显示的URL显示为这些标识符的医学文献查询，或xmlDoc中具有相同的数据对象。


用法----------Usage----------


pubmed(...,disp=c("data","browser"), type=c("uid","accession"),
       pmaddress=.efetch("PubMed", disp, type))



参数----------Arguments----------

参数：...
Vectorized set of Pubmed ID's
医学ID的矢量集


参数：disp
Either "Data" or "Browser" (default is data).  Data returns a XMLDoc, while Browser will display information in the user's browser.
“数据”或“浏览器”（默认为数据）。数据返回xmlDoc中，而浏览器将显示在用户的浏览器的信息。


参数：type
Denotes whether the arguments are accession numbers or UIDS.  Defaults to uids.
表示参数是否加入数字或UID的。默认到的uid。


参数：pmaddress
Specific path to the pubmed efetch engine from the NCBI website.
具体路径PubMed的efetch引擎从NCBI网站。


Details

详情----------Details----------

A simple function to retrieve Pubmed data given a specific ID, either through XML or through a web browser.  This function will accept either pubmed accession numbers or NCBI UIDs (defined as a Pubmed ID or a Medline ID) - although the types must not be mixed in a single call.
检索医学文献数据给出一个特定的ID，可以通过XML或通过网络浏览器，一个简单的函数。这个函数将接受任何医学加入号码或NCBI的的UID（定义为医学ID或论文编号） - 虽然不能混在一个单一的通话类型。

WARNING:  The powers that be at NCBI have been known to ban the IP addresses of users who abuse their servers (currently defined as less then 2 seconds between queries).  Do NOT put this function in a tight loop or you may find your access revoked.
警告：在NCBI的权力，已被禁止滥用自己的服务器（目前定义查询之间小于2秒）的用户的IP地址。不要把这个功能在一个紧凑的循环，或者您可能会发现您的访问撤销。


值----------Value----------

If the option "data" is used, an object of type XMLDoc is returned, unless there was an error with the query in which case an object of type try-error is returned.
如果“数据”选项被使用，返回类型xmlDoc中的对象，除非有一个错误类型的尝试错误的对象，在这种情况下，返回查询。

If the option "browser" is used, nothing is returned.
如果使用“浏览器”选项，并没有返回。


作者（S）----------Author(s)----------


R. Gentleman



参见----------See Also----------

genbank, xmlTreeParse
genbank，xmlTreeParse


举例----------Examples----------


   if( interactive() )
    opts <- c("data","browser") else
    opts <- "data"
   for (dp in opts)
     pubmed("11780146","11886385","11884611",disp=dp)

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。