R语言 annotate包 getGOTerm()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

getGOTerm(annotate)
getGOTerm()所属R语言包：annotate

                                        Functions to Access GO data.
                                         访问返回数据的功能。

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

These functions provide access to data in the GO package. The data are assembled from publically available data from the Gene Ontology Consortium (GO), www.go.org. Given a list of GO identifiers they access the children (more specific terms), the parents (less specific terms) and the terms themselves.
这些功能提供了在GO包的数据的访问。从公开的数据从基因本体协会（GO），www.go.org数据组装。由于GO的标识符列表，他们访问的儿童（更具体的条款），父母（不太具体条款）条款本身。


用法----------Usage----------


getGOTerm(x)
getGOParents(x)
getGOChildren(x)
getGOOntology(x)



参数----------Arguments----------

参数：x
A character vector of valid GO identifiers.  
一个有效的好标识符的字符向量。


Details

详情----------Details----------

GO consists of three (soon to be more) specific hierarchies: Molecular Function (MF), Biological Process (BP) and Cellular Component (CC). For more details consult the GO website. For each GO identifier each of these three hierarchies is searched and depending on the function called the appropriate values are obtained and returned.
转到由三（即将更）具体层次：分子功能（MF），生物过程（BP）和单元组件（CC）。有关详细信息，咨询的好网站。这三个层次，每年为每个GO标识符搜索和视功能称为得到适当的值并返回。

It is possible for a GO identifier to have no children or for it to have no parents. However, it must have a term associated with it.
这是一个GO标识符可能没有子女或没有父母。但是，必须有与之相关的一个术语。


值----------Value----------

A list of the same length as x. The list contains one entry for each element of x. That entry is itself a list. With one component named Ontology which has as its value one of MF, BP or CC. The second component has the same name as the suffix of the call, i.e. Children, Parents, or Term. If there was no match in any of the ontologies then a length zero list is returned for that element of x.
相同的长度为x名单。列表中包含一个条目每个x元素。该项目本身就是一个列表。随着一个名为Ontology作为其价值之一的MF，BP或CC的组成部分。第二部分有呼叫的后缀为名称相同，即儿童，家长，或期限。如果没有任何本体的比赛，然后返回长度为零的列表该x元素。

For getGOOntology a vector of categories (the names of which are the original GO term names). Elements of this list that are NA indicate term names for which there is no category (and hence they are not really term names).
getGOOntology一类向量（其中原任期名称的名称）。此列表的元素是NA表明术语的名称有没有类别（因此他们是不是真正的术语名称）。


作者（S）----------Author(s)----------


R. Gentleman



参考文献----------References----------

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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