SGCS-funs(SGCS)
SGCS-funs()所属R语言包:SGCS
Connectivity function, Cumulative Connectivity function and Clustering Function.
连接功能,累积连接功能和聚类功能。
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Statistical measures based on edges of a geometric graph structure over a given point pattern data.
的统计量基于在一个给定的点图案数据的几何的图形结构的边缘上。
The graph given components are used as clusters. In this version we use geometric graph, meaning points x and y are connected if ||x-y||<R for the given range parameter R. Notice that in clustering function, the R equals to the parameter r. If you have a another clustering structure in mind, you can give the spatgraphs-object using the prepGraph parameter.
的曲线给定构件被用作聚类。在这个版本中,我们使用几何的图形,这意味着点x和y连接| |x - y| | <R给定的范围参数R。请注意,在聚类功能,R等于参数r。如果你有一个又一个的簇结构在心中,你可以给spatgraphs对象prepGraph参数的。
The main function is spatial.graph.cluster.Fun, but the use of shortcuts confun, cumconfun and clustfun is highly encouraged.
其主要功能是spatial.graph.cluster.Fun,但使用的快捷键confun,cumconfun和clustfun备受鼓舞。
In addition, the triplet intensity function T (Schladitz & Baddeley 2000) is also included for now: The Tfun.
此外,还包括三重强度功能,T(Schladitz巴德利2000),现在的Tfun。
用法----------Usage----------
confun(X, r=NULL, R=NULL, h=NULL, ...)
cumconfun(X, r=NULL, R=NULL, ...)
clustfun(X, r=NULL, ...)
Tfun(X, r=NULL, ...)
spatial.graph.cluster.Fun(X, r=NULL, funtype=1, funpars=0,
minusRange=NULL, toroidal=FALSE,
doDists=FALSE, doWeights=FALSE,
prepGraph=NULL, dbg=FALSE)
参数----------Arguments----------
参数:X
All: Point pattern object of class ppp from package spatstat.
所有类的对象:点模式ppp套件“spatstat。
参数:r
Vector of the range parameters in which to calculate the function value. if NULL, a range from 0 to 1/3 of window length is used.
向量的的范围内的参数,其中计算的函数值。如果为NULL,范围从0到1/3的窗口长度被使用。
参数:R
confun, cumconfun: Clustering radius of the graph. If NULL, R=1/sqrt(lambda).
confun,cumconfun聚类半径的图形中。如果为NULL,R = 1/sqrt(λ)。
参数:h
confun: Smoothing parameter in kernel-estimation. Box kernel width = 2h. NULL-> h=0.15*R
confun:平滑参数在内核估计。箱内核宽度为2h。 NULL-> H = 0.15 * R
参数:...
Parametes for the function art1Fun:
parametes功能art1Fun:
参数:funtype
(shortcuts handle) Which function to calculate. confun=1, cumconfun=2, clustfun=3, Tfun=4.
(快捷键的句柄)函数来计算。 confun cumconfun = 2,clustfun = 3,Tfun = 4 = 1,。
参数:funpars
(shortcuts handle) Additional function parameter(s): confun fpar=c(R,h), cumconfun fpar=R.
(快捷键的句柄)的附加功能参数(S):confun FPAR = C(R,H),cumconfun FPAR = R.
参数:minusRange
clustfun, Tfun: Minus-correction parameter. Rectangular window required, NULL means no correction.
clustfun,Tfun:减校正参数。矩形窗口,NULL表示没有修正。
参数:toroidal
clustfun, Tfun: Toroidal correction of rectangular window.
clustfun,Tfun:环形纠正的矩形窗口。
参数:doDists
Precalculate distances for faster computation. Be aware of memory consumption n*(n-1).
预先计算距离,更快的计算。注意内存消耗N *(N-1)。
参数:doWeights
confun,cumconfun: Precalculate translation correction weights for faster computation. Be aware of memory consumption O(n\^2).
confun,cumconfun:预先计算的翻译校正更快的计算权重。注意内存消耗O(n \ ^ 2)。
参数:prepGraph
An optional graph-object from spatgraphs to be used as the component division of the points.
一个可选的图形对象可以使用从spatgraphs到划分的点作为组分。
参数:dbg
Print additional messages.
打印更多的信息。
值----------Value----------
Object of class fv, see spatstat for details. Has plot, envelope etc. nice methods.
对象的类fv,请参阅spatstat的详细信息。有图,信封等。不错的方法。
(作者)----------Author(s)----------
Tuomas Rajala<br>
University of Jyvaskyla, Finland<br>
tuomas.rajala@iki.fi
参考文献----------References----------
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注:
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