R语言 annotate包 chromLocation-class()函数中文帮助文档(中英文对照)

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chromLocation-class(annotate)
chromLocation-class()所属R语言包：annotate

                                        Class chromLocation, a class for describing genes and their
                                         的类chromLocation，一类用于描述基因及其

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This class provides chromosomal information provided by a Bioconductor metadata package.  By creating the object once for a particular package, it can be used in a variety of locations without the need to recomputed values repeatedly.
这个类提供了由Bioconductor元数据包提供的染色体信息。对象一旦创建一个特定的包，它可以被用来在不同的位置，而不需要多次重新计算值。


创建对象----------Creating Objects----------

  new('chromLocation',     organism     = ...., # Object of class character<br>     dataSource    = ...., # Object of class character<br>     chromLocs    = ...., # Object of class list<br>     probesToChrom  = ...., # Object of class ANY<br>     chromInfo    = ...., # Object of class numeric<br>     geneSymbols  = ...., # Object of class ANY<br>
  new('chromLocation',    organism     = ...., # Object of class character参考    dataSource    = ...., # Object of class character参考    chromLocs    = ...., # Object of class list参考    probesToChrom  = ...., # Object of class ANY参考    chromInfo    = ...., # Object of class numeric参考    geneSymbols  = ...., # Object of class ANY参考


插槽----------Slots----------




organism: Object of class "character".  The organism
organism：“人物”类的对象。有机体




dataSource: Object of class "character".  The source of
dataSource：“人物”类的对象。之源




chromLocs: Object of class "list".  A list which
chromLocs：类“名单”的对象。一个列表




probesToChrom: An object with an environment-like API which will translate a probe identifier to chromosome it belongs
probesToChrom“：对象与环境的API，这将转化染色体探针标识符，它属于




chromInfo: A numerical vector representing each chromosome, where the names are the names of the chromosomes and
chromInfo：每个染色体代表一个数值向量，其中姓名是染色体的名称和




geneSymbols: An environment or an object with environment-like API that maps a probe ID to
geneSymbols：一种环境或与环境状的API的对象映射一个探针ID


方法----------Methods----------




chromLengths (chromLocation): Gets the lengths of the
chromLengths（chromLocation）：获取的长度




chromLocs (chromLocation): Gets the 'chromLocs' attribute.
chromLocs（chromLocation）：获取chromLocs属性。




chromNames (chromLocation): Gets the name of the chromosomes
chromNames（chromLocation）：获取染色体的名称




dataSource (chromLocation): Gets the 'dataSource' attribute.
数据源（chromLocation）：获取数据源“属性。




probesToChrom (chromLocation): Gets the 'probesToChrom' attribute.
probesToChrom（chromLocation）：获取probesToChrom属性。




nChrom (chromLocation): gets the number of chromosomes this
nChrom（chromLocation）：得到的染色体数目




organism (chromLocation): gets the 'organism' attribute.
生物体（chromLocation）：获得“有机体”的属性。




chromInfo Gets the 'chromInfo' attribute.
chromInfo获取属性“chromInfo”。




geneSymbols Gets the 'geneSymbols' attribute.
geneSymbols获取属性“geneSymbols”。


参见----------See Also----------

buildChromLocation
buildChromLocation


举例----------Examples----------


  library("hgu95av2.db")

  z <- buildChromLocation("hgu95av2")
  
  ## find the number of chromosomes[＃发现的染色体数目。]
  nChrom(z)

  ## Find the names of the chromosomes[＃寻找染色体的名字。]
  chromNames(z)

  ## get the organism this object refers to[＃得到这个对象是指生物体]
  organism(z)

  ## get the lengths of the chromosomes in this object[＃在此对象的染色体的长度]
  chromLengths(z)

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。