accessionToUID(annotate)
accessionToUID()所属R语言包:annotate
A function to convert accession values to NCBI UIDs.
函数加入值转换到NCBI的UID。
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Given one or more accession values, this function will attempt to convert them into NCBI UID values.
由于一个或多个加入值,此功能将尝试转换成NCBI的UID值。
用法----------Usage----------
accessionToUID(...,db=c("genbank","pubmed"))
参数----------Arguments----------
参数:...
Accession numbers to be transformed.
加入号码进行改造。
参数:db
Which database this accession number refers to, defaults to Genbank
此加入数字是指哪一个数据库,默认为序列
Details
详情----------Details----------
Utilizes the PubMed tool pmqty.cgi to convert an accession number into a valid NCBI UID number.
利用医学工具pmqty.cgi的转换成一个有效的NCBI UID号登录号。
WARNING: The powers that be at NCBI have been known to ban the IP addresses of users who abuse their servers (currently defined as less then 2 seconds between queries). Do NOT put this function in a type loop or you may find your access revoked.
警告:在NCBI的权力,已被禁止滥用自己的服务器(目前定义查询之间小于2秒)的用户的IP地址。不要把此功能或类型的循环中,您可能会发现您的访问撤销。
值----------Value----------
Returns either a valid NCBI UID value or NULL (if there was nothing available).
返回一个有效的NCBI的UID值或NULL(如果有没有可用的)。
作者(S)----------Author(s)----------
Jeff Gentry
参见----------See Also----------
pubmed, xmlTreeParse
pubmed,xmlTreeParse
举例----------Examples----------
## The two returns from genbank should be the same[#从GenBank中两个回报应该是相同的]
xdoc <- genbank("U03397",type="accession",disp="data")
x <- accessionToUID("U03397",db="genbank")
xdoc <- genbank(x, type="uid",disp="data")
## Can handle multiple inputs[#可以处理多个输入]
y <- accessionToUID("M16653","U892893",db="genbank")
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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