R语言 seqRFLP包 enzCut()函数中文帮助文档(中英文对照)

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enzCut(seqRFLP)
enzCut()所属R语言包：seqRFLP

                                        Restriction enzyme cutting pattern
                                         限制性内切酶切割模式

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Function for calculating Restriction enzyme cutting pattern
限制性内切酶的切割图形，用于计算功能


用法----------Usage----------


enzCut(DNAsq, enznames, enzdata = enzdata)



参数----------Arguments----------

参数：DNAsq
The input fasta data.
输入fasta格式的数据。


参数：enznames
A character vector of the restriction enzyme's names, from one to multiple names.  
向量的限制性内切酶的名称的字符，从一个到多个名称。


参数：enzdata
Dataframe with first column for enzyme names, second column for enzyme cutting patterns.
酶的名称，用于酶的切割模式的第二列与第一列数据框。


Details

详细信息----------Details----------

Users could add restriction sites manually according to the enzdata styles.
用户可以添加酶切位点，手动根据的enzdata风格。


值----------Value----------

<table summary="R valueblock"> <tr valign="top"><td>enz </td> <td> The selected restriction enzyme.</td></tr> <tr valign="top"><td>RFLP.site </td> <td> The sites recognized by enzyme. </td></tr> <tr valign="top"><td>RFLP.frag </td> <td> The fragments generated by enzyme cutting.</td></tr> <tr valign="top"><td>TRFLP </td> <td> The fragments predicted by TRFLP</td></tr>
<table summary="R valueblock"> <tr valign="top"> <TD> enz </ TD> <TD>选定的限制性内切酶。</ TD> </ TR> <TR VALIGN =“顶“<TD> RFLP.site  </ TD> <TD>的网站公认的酶。 </ TD> </ TR> <tr valign="top"> <TD>RFLP.frag  </ TD> <TD>所产生的内切酶片段。</ TD> </ TR> <TR VALIGN = “顶”> <TD> TRFLP </ TD> <TD>预测的片段TRFLP </ TD> </ TR>

</table>
</ TABLE>


（作者）----------Author(s)----------



Qiong Ding <a href="mailto:dingqiong1@gmail.com">dingqiong1@gmail.com</a>




参考文献----------References----------

None.

参见----------See Also----------

See Also frag.dat
请参见frag.dat


实例----------Examples----------



## enzCut() example[：＃enzCut（）的例子]
data(enzdata)
enznames <- c("EcoRI", "Acc65I")
data(fil.phy)
fas <- ConvFas(fil = fil.phy, type = "phy")
enzCut(DNAsq = fas[2], enznames = "AluI", enzdata = enzdata)


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